RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261947.4

RNF130-201, Transcript of ring finger protein 130, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF130, Length 1,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF130-201ENST00000261947 PLCH2O75038 1416 aa41.56■■■■■ 4.24
RNF130-201ENST00000261947 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.52■■■■■ 4.24
RNF130-201ENST00000261947 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
RNF130-201ENST00000261947 DIP2BQ9P265 1576 aa41.51■■■■■ 4.24
RNF130-201ENST00000261947 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
RNF130-201ENST00000261947 GLI2P10070 1586 aa41.5■■■■■ 4.23
RNF130-201ENST00000261947 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.48■■■■■ 4.23
RNF130-201ENST00000261947 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.48■■■■■ 4.23
RNF130-201ENST00000261947 CD109Q6YHK3 1445 aa41.45■■■■■ 4.23
RNF130-201ENST00000261947 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.42■■■■■ 4.22
RNF130-201ENST00000261947 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.41■■■■■ 4.22
RNF130-201ENST00000261947 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.41■■■■■ 4.22
RNF130-201ENST00000261947 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.41■■■■■ 4.22
RNF130-201ENST00000261947 ITGAEP38570 1179 aa41.4■■■■■ 4.22
RNF130-201ENST00000261947 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.36■■■■■ 4.21
RNF130-201ENST00000261947 FANCAO15360 1455 aa41.34■■■■■ 4.21
RNF130-201ENST00000261947 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
RNF130-201ENST00000261947 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.28■■■■■ 4.2
RNF130-201ENST00000261947 DAPK1P53355 1430 aa41.25■■■■■ 4.19
RNF130-201ENST00000261947 PTPRKQ15262 1439 aa41.25■■■■■ 4.19
RNF130-201ENST00000261947 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.25■■■■■ 4.19
RNF130-201ENST00000261947 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.25■■■■■ 4.19
RNF130-201ENST00000261947 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.25■■■■■ 4.196e-7■■■■□ 24.1
RNF130-201ENST00000261947 ABCC5O15440 1437 aa41.24■■■■■ 4.19
RNF130-201ENST00000261947 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.24■■■■■ 4.19
RNF130-201ENST00000261947 MBD5Q9P267 1494 aa41.23■■■■■ 4.19
RNF130-201ENST00000261947 ABCC1P33527 1531 aa41.23■■■■■ 4.19
RNF130-201ENST00000261947 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.22■■■■■ 4.19
RNF130-201ENST00000261947 TSPOAP1O95153 1857 aa41.2■■■■■ 4.19
RNF130-201ENST00000261947 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.19■■■■■ 4.18
RNF130-201ENST00000261947 AKNAQ7Z591 1439 aa41.18■■■■■ 4.18
RNF130-201ENST00000261947 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.17■■■■■ 4.18
RNF130-201ENST00000261947 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.16■■■■■ 4.18
RNF130-201ENST00000261947 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
RNF130-201ENST00000261947 NEO1Q92859 1461 aa41.15■■■■■ 4.18
RNF130-201ENST00000261947 ADGRL1O94910 1474 aa41.15■■■■■ 4.18
RNF130-201ENST00000261947 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.13■■■■■ 4.17
RNF130-201ENST00000261947 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.11■■■■■ 4.17
RNF130-201ENST00000261947 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.09■■■■■ 4.17
RNF130-201ENST00000261947 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.07■■■■■ 4.16
RNF130-201ENST00000261947 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.06■■■■■ 4.16
RNF130-201ENST00000261947 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.06■■■■■ 4.16
RNF130-201ENST00000261947 TSPY4P0CV99 314 aa41.05■■■■■ 4.16
RNF130-201ENST00000261947 TSPY10P0CW01 314 aa41.05■■■■■ 4.16
RNF130-201ENST00000261947 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
RNF130-201ENST00000261947 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.01■■■■■ 4.16
RNF130-201ENST00000261947 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.01■■■■■ 4.16
RNF130-201ENST00000261947 ROCK1Q13464 1354 aa40.99■■■■■ 4.15
RNF130-201ENST00000261947 AFAP1Q8N556 730 aa40.97■■■■■ 4.15
RNF130-201ENST00000261947 ADGRL2O95490 1459 aa40.96■■■■■ 4.15
RNF130-201ENST00000261947 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.96■■■■■ 4.15
RNF130-201ENST00000261947 HFM1A2PYH4 1435 aa40.96■■■■■ 4.15
RNF130-201ENST00000261947 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.95■■■■■ 4.15
RNF130-201ENST00000261947 NCOA1Q15788 1441 aa40.93■■■■■ 4.14
RNF130-201ENST00000261947 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.93■■■■■ 4.14
RNF130-201ENST00000261947 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.92■■■■■ 4.14
RNF130-201ENST00000261947 NAIPQ13075 1403 aa40.91■■■■■ 4.14
RNF130-201ENST00000261947 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.91■■■■■ 4.14
RNF130-201ENST00000261947 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.91■■■■■ 4.14
RNF130-201ENST00000261947 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
RNF130-201ENST00000261947 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.89■■■■■ 4.14
RNF130-201ENST00000261947 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
RNF130-201ENST00000261947 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.84■■■■■ 4.13
RNF130-201ENST00000261947 RICTORQ6R327 1708 aa40.83■■■■■ 4.13
RNF130-201ENST00000261947 KDM5CP41229 1560 aa40.83■■■■■ 4.13
RNF130-201ENST00000261947 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.83■■■■■ 4.13
RNF130-201ENST00000261947 RAPGEF3O95398 923 aa40.82■■■■■ 4.13
RNF130-201ENST00000261947 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.81■■■■■ 4.12
RNF130-201ENST00000261947 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
RNF130-201ENST00000261947 PLXNC1O60486 1568 aa40.8■■■■■ 4.12
RNF130-201ENST00000261947 ATP7AQ04656 1500 aa40.78■■■■■ 4.12
RNF130-201ENST00000261947 KIF15Q9NS87 1388 aa40.76■■■■■ 4.12
RNF130-201ENST00000261947 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.74■■■■■ 4.11
RNF130-201ENST00000261947 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.74■■■■■ 4.11
RNF130-201ENST00000261947 HRCP23327 699 aa40.72■■■■■ 4.11
RNF130-201ENST00000261947 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.72■■■■■ 4.11
RNF130-201ENST00000261947 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.72■■■■■ 4.11
RNF130-201ENST00000261947 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.72■■■■■ 4.11
RNF130-201ENST00000261947 KDM6BO15054 1643 aa40.71■■■■■ 4.11
RNF130-201ENST00000261947 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.11
RNF130-201ENST00000261947 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.67■■■■■ 4.1
RNF130-201ENST00000261947 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.63■■■■■ 4.1
RNF130-201ENST00000261947 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.63■■■■■ 4.1
RNF130-201ENST00000261947 ABCA6Q8N139 1617 aa40.55■■■■■ 4.08
RNF130-201ENST00000261947 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.53■■■■■ 4.08
RNF130-201ENST00000261947 ERBINQ96RT1 1412 aa40.53■■■■■ 4.08
RNF130-201ENST00000261947 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.5■■■■■ 4.07
RNF130-201ENST00000261947 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.49■■■■■ 4.07
RNF130-201ENST00000261947 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
RNF130-201ENST00000261947 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
RNF130-201ENST00000261947 A2MP01023 1474 aa40.46■■■■■ 4.07
RNF130-201ENST00000261947 TRIM52Q96A61 297 aa40.46■■■■■ 4.07
RNF130-201ENST00000261947 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
RNF130-201ENST00000261947 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
RNF130-201ENST00000261947 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
RNF130-201ENST00000261947 UNC13BO14795 1591 aa40.35■■■■■ 4.05
RNF130-201ENST00000261947 ATP10AO60312 1499 aa40.35■■■■■ 4.05
RNF130-201ENST00000261947 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.34■■■■■ 4.05
RNF130-201ENST00000261947 KIF3BO15066 747 aa40.31■■■■■ 4.04
RNF130-201ENST00000261947 NUP155O75694 1391 aa40.3■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms