RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
LAMC1-201ENST00000258341 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.86■□□□□ 0.93
LAMC1-201ENST00000258341 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
LAMC1-201ENST00000258341 KANK1Q14678 1352 aa20.84■□□□□ 0.93
LAMC1-201ENST00000258341 CFAP44Q96MT7 982 aa20.82■□□□□ 0.92
LAMC1-201ENST00000258341 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.82■□□□□ 0.92
LAMC1-201ENST00000258341 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.8■□□□□ 0.92
LAMC1-201ENST00000258341 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.8■□□□□ 0.92
LAMC1-201ENST00000258341 TMF1P82094 1093 aa20.8■□□□□ 0.92
LAMC1-201ENST00000258341 GORABQ5T7V8 394 aa20.79■□□□□ 0.92
LAMC1-201ENST00000258341 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.79■□□□□ 0.92
LAMC1-201ENST00000258341 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.78■□□□□ 0.92
LAMC1-201ENST00000258341 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.78■□□□□ 0.92
LAMC1-201ENST00000258341 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
LAMC1-201ENST00000258341 ARID3AQ99856 593 aa20.77■□□□□ 0.92
LAMC1-201ENST00000258341 STK26Q9P289 416 aa20.77■□□□□ 0.92
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LAMC1-201ENST00000258341 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
LAMC1-201ENST00000258341 TPM4P67936 248 aa20.76■□□□□ 0.91
LAMC1-201ENST00000258341 MORC1Q86VD1 984 aa20.76■□□□□ 0.91
LAMC1-201ENST00000258341 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.74■□□□□ 0.91
LAMC1-201ENST00000258341 GPATCH3Q96I76 525 aa20.73■□□□□ 0.91
LAMC1-201ENST00000258341 VPS53Q5VIR6 699 aa20.73■□□□□ 0.91
LAMC1-201ENST00000258341 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.73■□□□□ 0.91
LAMC1-201ENST00000258341 GOLGA3Q08378 1498 aa20.73■□□□□ 0.91
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.73■□□□□ 0.91
LAMC1-201ENST00000258341 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.72■□□□□ 0.91
LAMC1-201ENST00000258341 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
LAMC1-201ENST00000258341 CEP89Q96ST8 783 aa20.71■□□□□ 0.91
LAMC1-201ENST00000258341 FBXO3Q9UK99 471 aa20.71■□□□□ 0.91
LAMC1-201ENST00000258341 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.69■□□□□ 0.9
LAMC1-201ENST00000258341 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
LAMC1-201ENST00000258341 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.68■□□□□ 0.9
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LAMC1-201ENST00000258341 GBP4Q96PP9 640 aa20.68■□□□□ 0.9
LAMC1-201ENST00000258341 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.67■□□□□ 0.9
LAMC1-201ENST00000258341 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
LAMC1-201ENST00000258341 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
LAMC1-201ENST00000258341 PTMSP20962 102 aa20.66■□□□□ 0.9
LAMC1-201ENST00000258341 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
LAMC1-201ENST00000258341 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
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LAMC1-201ENST00000258341 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
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LAMC1-201ENST00000258341 MARCH6O60337 910 aa20.62■□□□□ 0.89
LAMC1-201ENST00000258341 CEP162Q5TB80 1403 aa20.6■□□□□ 0.89
LAMC1-201ENST00000258341 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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LAMC1-201ENST00000258341 WWC1Q8IX03 1113 aa20.58■□□□□ 0.89
LAMC1-201ENST00000258341 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.58■□□□□ 0.89
LAMC1-201ENST00000258341 MSH5O43196 834 aa20.58■□□□□ 0.88
LAMC1-201ENST00000258341 KLHL34Q8N239 644 aa20.57■□□□□ 0.88
LAMC1-201ENST00000258341 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
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LAMC1-201ENST00000258341 USP35Q9P2H5 1018 aa20.56■□□□□ 0.88
LAMC1-201ENST00000258341 STK31Q9BXU1 1019 aa20.55■□□□□ 0.88
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LAMC1-201ENST00000258341 TOMM22Q9NS69 142 aa20.54■□□□□ 0.88
LAMC1-201ENST00000258341 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LAMC1-201ENST00000258341 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
LAMC1-201ENST00000258341 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LAMC1-201ENST00000258341 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.53■□□□□ 0.88
LAMC1-201ENST00000258341 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LAMC1-201ENST00000258341 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
LAMC1-201ENST00000258341 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.52■□□□□ 0.88
LAMC1-201ENST00000258341 TPM3P06753 285 aa20.52■□□□□ 0.88
LAMC1-201ENST00000258341 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
LAMC1-201ENST00000258341 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
LAMC1-201ENST00000258341 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
LAMC1-201ENST00000258341 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
LAMC1-201ENST00000258341 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.49■□□□□ 0.87
LAMC1-201ENST00000258341 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LAMC1-201ENST00000258341 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LAMC1-201ENST00000258341 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LAMC1-201ENST00000258341 PHF14O94880 888 aa20.48■□□□□ 0.87
LAMC1-201ENST00000258341 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
LAMC1-201ENST00000258341 KIF16BQ96L93 1317 aa20.46■□□□□ 0.87
LAMC1-201ENST00000258341 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LAMC1-201ENST00000258341 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.45■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.45■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.44■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.44■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 RAD21O60216 631 aa20.44■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 HMMRO75330 724 aa20.44■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 H3BQV1 296 aa20.44■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 IFFO2Q5TF58 517 aa20.44■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.43■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 EEA1Q15075 1411 aa20.43■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.42■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 AMPHP49418 695 aa20.41■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.41■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 TPM2P07951 284 aa20.41■□□□□ 0.86
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