RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253451.8

CCL25-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CCL25, Length 953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25-201ENST00000253451 PLCH2O75038 1416 aa24.32■■□□□ 1.48
CCL25-201ENST00000253451 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.32■■□□□ 1.48
CCL25-201ENST00000253451 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.31■■□□□ 1.48
CCL25-201ENST00000253451 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.27■■□□□ 1.48
CCL25-201ENST00000253451 FANCAO15360 1455 aa24.26■■□□□ 1.47
CCL25-201ENST00000253451 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.25■■□□□ 1.47
CCL25-201ENST00000253451 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.25■■□□□ 1.47
CCL25-201ENST00000253451 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.23■■□□□ 1.47
CCL25-201ENST00000253451 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.23■■□□□ 1.47
CCL25-201ENST00000253451 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CCL25-201ENST00000253451 MIA2Q96PC5 1412 aa24.21■■□□□ 1.47
CCL25-201ENST00000253451 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.2■■□□□ 1.47
CCL25-201ENST00000253451 NEO1Q92859 1461 aa24.19■■□□□ 1.46
CCL25-201ENST00000253451 ABCC1P33527 1531 aa24.19■■□□□ 1.46
CCL25-201ENST00000253451 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.17■■□□□ 1.46
CCL25-201ENST00000253451 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CCL25-201ENST00000253451 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CCL25-201ENST00000253451 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CCL25-201ENST00000253451 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.16■■□□□ 1.46
CCL25-201ENST00000253451 AKNAQ7Z591 1439 aa24.16■■□□□ 1.46
CCL25-201ENST00000253451 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CCL25-201ENST00000253451 ADGRL1O94910 1474 aa24.14■■□□□ 1.46
CCL25-201ENST00000253451 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.12■■□□□ 1.45
CCL25-201ENST00000253451 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.11■■□□□ 1.45
CCL25-201ENST00000253451 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.08■■□□□ 1.44
CCL25-201ENST00000253451 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CCL25-201ENST00000253451 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.07■■□□□ 1.44
CCL25-201ENST00000253451 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.07■■□□□ 1.44
CCL25-201ENST00000253451 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.07■■□□□ 1.44
CCL25-201ENST00000253451 RICTORQ6R327 1708 aa24.07■■□□□ 1.44
CCL25-201ENST00000253451 MBD5Q9P267 1494 aa24.06■■□□□ 1.44
CCL25-201ENST00000253451 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CCL25-201ENST00000253451 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.05■■□□□ 1.44
CCL25-201ENST00000253451 KDM6BO15054 1643 aa24.05■■□□□ 1.44
CCL25-201ENST00000253451 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.04■■□□□ 1.44
CCL25-201ENST00000253451 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.04■■□□□ 1.44
CCL25-201ENST00000253451 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CCL25-201ENST00000253451 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CCL25-201ENST00000253451 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
CCL25-201ENST00000253451 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.01■■□□□ 1.43
CCL25-201ENST00000253451 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
CCL25-201ENST00000253451 KDM5CP41229 1560 aa23.99■■□□□ 1.43
CCL25-201ENST00000253451 DAPK1P53355 1430 aa23.99■■□□□ 1.43
CCL25-201ENST00000253451 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.99■■□□□ 1.43
CCL25-201ENST00000253451 ABCC5O15440 1437 aa23.98■■□□□ 1.43
CCL25-201ENST00000253451 RAPGEF3O95398 923 aa23.96■■□□□ 1.43
CCL25-201ENST00000253451 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.95■■□□□ 1.43
CCL25-201ENST00000253451 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.95■■□□□ 1.42
CCL25-201ENST00000253451 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
CCL25-201ENST00000253451 AFAP1Q8N556 730 aa23.94■■□□□ 1.42
CCL25-201ENST00000253451 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.94■■□□□ 1.42
CCL25-201ENST00000253451 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.93■■□□□ 1.42
CCL25-201ENST00000253451 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.93■■□□□ 1.42
CCL25-201ENST00000253451 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.92■■□□□ 1.42
CCL25-201ENST00000253451 PTPRKQ15262 1439 aa23.92■■□□□ 1.42
CCL25-201ENST00000253451 ITGAEP38570 1179 aa23.91■■□□□ 1.42
CCL25-201ENST00000253451 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.91■■□□□ 1.42
CCL25-201ENST00000253451 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.91■■□□□ 1.42
CCL25-201ENST00000253451 ATP7AQ04656 1500 aa23.9■■□□□ 1.42
CCL25-201ENST00000253451 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.88■■□□□ 1.41
CCL25-201ENST00000253451 ABCA6Q8N139 1617 aa23.88■■□□□ 1.41
CCL25-201ENST00000253451 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.87■■□□□ 1.41
CCL25-201ENST00000253451 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CCL25-201ENST00000253451 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.85■■□□□ 1.41
CCL25-201ENST00000253451 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
CCL25-201ENST00000253451 PLXNC1O60486 1568 aa23.85■■□□□ 1.41
CCL25-201ENST00000253451 ADGRL2O95490 1459 aa23.84■■□□□ 1.41
CCL25-201ENST00000253451 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CCL25-201ENST00000253451 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.84■■□□□ 1.41
CCL25-201ENST00000253451 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.83■■□□□ 1.41
CCL25-201ENST00000253451 TSPY4P0CV99 314 aa23.83■■□□□ 1.41
CCL25-201ENST00000253451 TSPY10P0CW01 314 aa23.83■■□□□ 1.41
CCL25-201ENST00000253451 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.83■■□□□ 1.41
CCL25-201ENST00000253451 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.82■■□□□ 1.4
CCL25-201ENST00000253451 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.81■■□□□ 1.4
CCL25-201ENST00000253451 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.81■■□□□ 1.4
CCL25-201ENST00000253451 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.8■■□□□ 1.4
CCL25-201ENST00000253451 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.77■■□□□ 1.4
CCL25-201ENST00000253451 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.76■■□□□ 1.39
CCL25-201ENST00000253451 NCOA1Q15788 1441 aa23.76■■□□□ 1.39
CCL25-201ENST00000253451 ROCK1Q13464 1354 aa23.76■■□□□ 1.39
CCL25-201ENST00000253451 KIF15Q9NS87 1388 aa23.75■■□□□ 1.39
CCL25-201ENST00000253451 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.73■■□□□ 1.39
CCL25-201ENST00000253451 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.73■■□□□ 1.39
CCL25-201ENST00000253451 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.71■■□□□ 1.39
CCL25-201ENST00000253451 REREQ9P2R6 1566 aa23.7■■□□□ 1.38
CCL25-201ENST00000253451 ATP10AO60312 1499 aa23.7■■□□□ 1.38
CCL25-201ENST00000253451 A2MP01023 1474 aa23.7■■□□□ 1.38
CCL25-201ENST00000253451 HFM1A2PYH4 1435 aa23.68■■□□□ 1.38
CCL25-201ENST00000253451 NAIPQ13075 1403 aa23.68■■□□□ 1.38
CCL25-201ENST00000253451 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
CCL25-201ENST00000253451 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CCL25-201ENST00000253451 ERBINQ96RT1 1412 aa23.63■■□□□ 1.37
CCL25-201ENST00000253451 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.63■■□□□ 1.37
CCL25-201ENST00000253451 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.63■■□□□ 1.37
CCL25-201ENST00000253451 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.62■■□□□ 1.37
CCL25-201ENST00000253451 AGLP35573 1532 aa23.6■■□□□ 1.37
CCL25-201ENST00000253451 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.59■■□□□ 1.37
CCL25-201ENST00000253451 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
CCL25-201ENST00000253451 DEPDC5O75140 1603 aa23.56■■□□□ 1.36
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