RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253339.9

LATS1-201, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LATS1, Length 4,256 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-201ENST00000253339 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LATS1-201ENST00000253339 DDRGK1Q96HY6 314 aa5.43□□□□□ -1.54
LATS1-201ENST00000253339 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
LATS1-201ENST00000253339 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
LATS1-201ENST00000253339 TRIM66O15016 1216 aa5.42□□□□□ -1.54
LATS1-201ENST00000253339 TRAK2O60296 914 aa5.42□□□□□ -1.54
LATS1-201ENST00000253339 RETREG2Q8NC44 543 aa5.42□□□□□ -1.54
LATS1-201ENST00000253339 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
LATS1-201ENST00000253339 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
LATS1-201ENST00000253339 SERPINA10Q9UK55 444 aa5.4□□□□□ -1.54
LATS1-201ENST00000253339 RFX1P22670 979 aa5.4□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 NUBP1P53384 320 aa5.38□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 GRXCR2A6NFK2 248 aa5.37□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 PCDHB8Q9UN66 801 aa5.36□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa5.36□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 PDE4AP27815 886 aa5.35□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 WWC1Q8IX03 1113 aa5.35□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 CHMP4AQ9BY43 222 aa5.35□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 RASEFQ8IZ41 740 aa5.35□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 PRR29P0C7W0 189 aa5.35□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 TRAIPQ9BWF2 469 aa5.35□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 SSUH2Q9Y2M2 353 aa5.35□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 CCDC27Q2M243 656 aa5.34□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 POLR3EQ9NVU0 708 aa5.34□□□□□ -1.55
LATS1-201ENST00000253339 GOLGA2Q08379 1002 aa5.34□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 CABP2Q9NPB3 220 aa5.34□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 PPP1R37O75864 691 aa5.33□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 RGS22Q8NE09 1264 aa5.33□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 POM121Q96HA1 1249 aa5.32□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa5.32□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 CCDC102AQ96A19 550 aa5.32□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 A6NJR5 290 aa5.31□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 NLRP6P59044 892 aa5.31□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 PCGF6Q9BYE7 350 aa5.31□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 ABL2P42684 1182 aa5.31□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 PSEN1P49768 467 aa5.31□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 PHF8Q9UPP1 1060 aa5.3□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 DPYSL4O14531 572 aa5.3□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 PARP9Q8IXQ6 854 aa5.3□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 MFRPQ9BY79 579 aa5.29□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 IRF5Q13568 498 aa5.29□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 PLEKHG3A1L390 1219 aa5.29□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 PDE4CQ08493 712 aa5.29□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 MCM6Q14566 821 aa5.29□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 EFCAB3Q8N7B9 438 aa5.28□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 RSPH4AQ5TD94 716 aa5.28□□□□□ -1.56
LATS1-201ENST00000253339 CARNS1A5YM72 827 aa5.27□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 CDCA8Q53HL2 280 aa5.27□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa5.26□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa5.26□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 SGIP1Q9BQI5 828 aa5.26□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 GDPD2Q9HCC8 539 aa5.25□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 PRM3Q9NNZ6 103 aa5.25□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 IRF6O14896 467 aa5.23□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 MAP2K5Q13163 448 aa5.23□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP5.22□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa5.22□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 GNPATO15228 680 aa5.22□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.57
LATS1-201ENST00000253339 MAP3K9P80192 1104 aa5.21□□□□□ -1.58
LATS1-201ENST00000253339 NEFLP07196 543 aa5.21□□□□□ -1.58
LATS1-201ENST00000253339 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa5.21□□□□□ -1.58
LATS1-201ENST00000253339 DDX12PQ92771 950 aa5.2□□□□□ -1.58
LATS1-201ENST00000253339 TSC1Q92574 1164 aa5.2□□□□□ -1.58
LATS1-201ENST00000253339 BEGAINQ9BUH8 593 aa5.2□□□□□ -1.58
LATS1-201ENST00000253339 PLSCR2Q9NRY7 297 aa5.2□□□□□ -1.58
LATS1-201ENST00000253339 COG6Q9Y2V7 657 aa5.2□□□□□ -1.58
LATS1-201ENST00000253339 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
LATS1-201ENST00000253339 GLMNQ92990 594 aa5.19□□□□□ -1.58
LATS1-201ENST00000253339 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
LATS1-201ENST00000253339 SNRKQ9NRH2 765 aa5.19□□□□□ -1.58
LATS1-201ENST00000253339 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
LATS1-201ENST00000253339 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
LATS1-201ENST00000253339 FCHSD2O94868 740 aa5.18□□□□□ -1.58
LATS1-201ENST00000253339 MS4A1P11836 297 aa5.18□□□□□ -1.58
LATS1-201ENST00000253339 FECHP22830 423 aa5.18□□□□□ -1.58
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