RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194214.9

HSPB11-201, Transcript of heat shock protein family B (small) member 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HSPB11, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11-201ENST00000194214 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.05■■■■■ 4.48
HSPB11-201ENST00000194214 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.04■■■■■ 4.48
HSPB11-201ENST00000194214 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.01■■■■■ 4.48
HSPB11-201ENST00000194214 KIF14Q15058 1648 aa43■■■■■ 4.47
HSPB11-201ENST00000194214 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
HSPB11-201ENST00000194214 CLIP1P30622 1438 aa42.98■■■■■ 4.47
HSPB11-201ENST00000194214 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.95■■■■■ 4.47
HSPB11-201ENST00000194214 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.92■■■■■ 4.46
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HSPB11-201ENST00000194214 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.88■■■■■ 4.46
HSPB11-201ENST00000194214 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.86■■■■■ 4.45
HSPB11-201ENST00000194214 ATP10AO60312 1499 aa42.86■■■■■ 4.45
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HSPB11-201ENST00000194214 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.84■■■■■ 4.45
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HSPB11-201ENST00000194214 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.82■■■■■ 4.45
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HSPB11-201ENST00000194214 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.79■■■■■ 4.44
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HSPB11-201ENST00000194214 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.75■■■■■ 4.43
HSPB11-201ENST00000194214 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.74■■■■■ 4.43
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HSPB11-201ENST00000194214 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.7■■■■■ 4.43
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HSPB11-201ENST00000194214 PREX2Q70Z35 1606 aa42.68■■■■■ 4.42
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HSPB11-201ENST00000194214 ABCC1P33527 1531 aa42.58■■■■■ 4.41
HSPB11-201ENST00000194214 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.58■■■■■ 4.41
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HSPB11-201ENST00000194214 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.54■■■■■ 4.4
HSPB11-201ENST00000194214 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.54■■■■■ 4.4
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HSPB11-201ENST00000194214 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.52■■■■■ 4.4
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HSPB11-201ENST00000194214 PREX1Q8TCU6 1659 aa42.42■■■■■ 4.38
HSPB11-201ENST00000194214 AGLP35573 1532 aa42.4■■■■■ 4.38
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HSPB11-201ENST00000194214 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.35■■■■■ 4.37
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HSPB11-201ENST00000194214 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.3■■■■■ 4.36
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HSPB11-201ENST00000194214 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.28■■■■■ 4.36
HSPB11-201ENST00000194214 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.28■■■■■ 4.36
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HSPB11-201ENST00000194214 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa42.27■■■■■ 4.36
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HSPB11-201ENST00000194214 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.24■■■■■ 4.35
HSPB11-201ENST00000194214 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.24■■■■■ 4.35
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HSPB11-201ENST00000194214 CERKQ8TCT0 537 aa42.15■■■■■ 4.34
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HSPB11-201ENST00000194214 CEP162Q5TB80 1403 aa42.12■■■■■ 4.33
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HSPB11-201ENST00000194214 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
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HSPB11-201ENST00000194214 PLXNC1O60486 1568 aa42.01■■■■■ 4.32
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HSPB11-201ENST00000194214 MBD5Q9P267 1494 aa41.95■■■■■ 4.31
HSPB11-201ENST00000194214 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.94■■■■■ 4.3
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HSPB11-201ENST00000194214 NCOA2Q15596 1464 aa41.85■■■■■ 4.29
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HSPB11-201ENST00000194214 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.64■■■■■ 4.26
HSPB11-201ENST00000194214 TSPY4P0CV99 314 aa41.62■■■■■ 4.25
HSPB11-201ENST00000194214 TSPY10P0CW01 314 aa41.62■■■■■ 4.25
HSPB11-201ENST00000194214 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.62■■■■■ 4.25
HSPB11-201ENST00000194214 PLA2R1Q13018 1463 aa41.6■■■■■ 4.25
HSPB11-201ENST00000194214 PKD2Q13563 968 aa41.6■■■■■ 4.25
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