RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 UACAQ9BZF9 1416 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXA11-201ENST00000006015 KIAA0556O60303 1618 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXA11-201ENST00000006015 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
HOXA11-201ENST00000006015 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXA11-201ENST00000006015 DEKP35659 375 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
HOXA11-201ENST00000006015 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXA11-201ENST00000006015 CEP170Q5SW79 1584 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXA11-201ENST00000006015 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
HOXA11-201ENST00000006015 KDM6BO15054 1643 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXA11-201ENST00000006015 SYNJ2O15056 1496 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXA11-201ENST00000006015 MIA2Q96PC5 1412 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXA11-201ENST00000006015 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXA11-201ENST00000006015 JPH4Q96JJ6 628 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXA11-201ENST00000006015 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXA11-201ENST00000006015 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
HOXA11-201ENST00000006015 FOXD1Q16676 465 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXA11-201ENST00000006015 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.95■■□□□ 1.91
HOXA11-201ENST00000006015 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXA11-201ENST00000006015 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
HOXA11-201ENST00000006015 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXA11-201ENST00000006015 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXA11-201ENST00000006015 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXA11-201ENST00000006015 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXA11-201ENST00000006015 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXA11-201ENST00000006015 DAPK1P53355 1430 aa26.89■■□□□ 1.89
HOXA11-201ENST00000006015 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXA11-201ENST00000006015 ABCC5O15440 1437 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXA11-201ENST00000006015 NUP160Q12769 1436 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXA11-201ENST00000006015 AKNAQ7Z591 1439 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXA11-201ENST00000006015 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
HOXA11-201ENST00000006015 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
HOXA11-201ENST00000006015 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXA11-201ENST00000006015 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
HOXA11-201ENST00000006015 CCDC184Q52MB2 194 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXA11-201ENST00000006015 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
HOXA11-201ENST00000006015 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXA11-201ENST00000006015 KIF14Q15058 1648 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXA11-201ENST00000006015 NCOA1Q15788 1441 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXA11-201ENST00000006015 ROCK1Q13464 1354 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXA11-201ENST00000006015 MRS2Q9HD23 443 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXA11-201ENST00000006015 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXA11-201ENST00000006015 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXA11-201ENST00000006015 NBR1Q14596 966 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXA11-201ENST00000006015 CCDC7Q96M83 1385 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXA11-201ENST00000006015 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
HOXA11-201ENST00000006015 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXA11-201ENST00000006015 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
HOXA11-201ENST00000006015 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXA11-201ENST00000006015 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
HOXA11-201ENST00000006015 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.7■■□□□ 1.87
HOXA11-201ENST00000006015 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXA11-201ENST00000006015 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXA11-201ENST00000006015 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXA11-201ENST00000006015 ATP10BO94823 1461 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXA11-201ENST00000006015 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXA11-201ENST00000006015 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXA11-201ENST00000006015 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
HOXA11-201ENST00000006015 ABCA8O94911 1581 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXA11-201ENST00000006015 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXA11-201ENST00000006015 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXA11-201ENST00000006015 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXA11-201ENST00000006015 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXA11-201ENST00000006015 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXA11-201ENST00000006015 PTPRGP23470 1445 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXA11-201ENST00000006015 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXA11-201ENST00000006015 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXA11-201ENST00000006015 NUDCQ9Y266 331 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXA11-201ENST00000006015 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXA11-201ENST00000006015 PZPP20742 1482 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXA11-201ENST00000006015 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXA11-201ENST00000006015 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
HOXA11-201ENST00000006015 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.51■■□□□ 1.84
HOXA11-201ENST00000006015 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 PKD2Q13563 968 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 ADGRL2O95490 1459 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 CHD1O14646 1710 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 TSPY4P0CV99 314 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXA11-201ENST00000006015 TSPY10P0CW01 314 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXA11-201ENST00000006015 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXA11-201ENST00000006015 NUP155O75694 1391 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXA11-201ENST00000006015 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXA11-201ENST00000006015 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXA11-201ENST00000006015 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXA11-201ENST00000006015 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.39■■□□□ 1.81
HOXA11-201ENST00000006015 USP35Q9P2H5 1018 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXA11-201ENST00000006015 KIF15Q9NS87 1388 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXA11-201ENST00000006015 MBD5Q9P267 1494 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXA11-201ENST00000006015 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXA11-201ENST00000006015 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
HOXA11-201ENST00000006015 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXA11-201ENST00000006015 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms