RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172142.7

Nisch-222, Transcript of Nischarin, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 2,780 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-222ENSMUST00000172142 NrdcQ8BHG1 1161 aa31.39■■■□□ 2.62
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kif27Q7M6Z4 1394 aa31.39■■■□□ 2.62
Nisch-222ENSMUST00000172142 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
Nisch-222ENSMUST00000172142 PxdnQ3UQ28 1475 aa31.38■■■□□ 2.61
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pprc1Q6NZN1 1644 aa31.37■■■□□ 2.61
Nisch-222ENSMUST00000172142 PrkcshO08795 521 aa31.34■■■□□ 2.61
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm13695A2AK44 830 aa31.32■■■□□ 2.6
Nisch-222ENSMUST00000172142 Abca16E9PWJ7 1678 aa31.32■■■□□ 2.6
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rusc2Q80U22 1514 aa31.3■■■□□ 2.6
Nisch-222ENSMUST00000172142 CadpsQ80TJ1 1355 aa31.3■■■□□ 2.6
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ncoa1P70365 1447 aa31.3■■■□□ 2.6
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gpatch8A2A6A1 1505 aa31.3■■■□□ 2.6
Nisch-222ENSMUST00000172142 Usp47Q8BY87 1376 aa31.29■■■□□ 2.6
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pkd2O35245 966 aa31.29■■■□□ 2.6
Nisch-222ENSMUST00000172142 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa31.29■■■□□ 2.6
Nisch-222ENSMUST00000172142 Adamts12Q811B3 1600 aa31.28■■■□□ 2.6
Nisch-222ENSMUST00000172142 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cabp1Q9JLK7 227 aa31.27■■■□□ 2.6
Nisch-222ENSMUST00000172142 NexmifQ5DTT1 1515 aa31.26■■■□□ 2.59
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rfx7F8VPJ6 1459 aa31.25■■■□□ 2.59
Nisch-222ENSMUST00000172142 Exoc6Q8R313 802 aa31.23■■■□□ 2.59
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gcc2Q8CHG3 1679 aa31.23■■■□□ 2.59
Nisch-222ENSMUST00000172142 Arhgap27A2AB59 869 aa31.21■■■□□ 2.59
Nisch-222ENSMUST00000172142 Setbp1Q9Z180 1582 aa31.2■■■□□ 2.59
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa31.2■■■□□ 2.58
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mug1P28665 1476 aa31.2■■■□□ 2.58
Nisch-222ENSMUST00000172142 P3h3Q8CG70 732 aa31.19■■■□□ 2.58
Nisch-222ENSMUST00000172142 Abca5Q8K448 1642 aa31.19■■■□□ 2.58
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
Nisch-222ENSMUST00000172142 BC005561E9Q5E2 1589 aa31.17■■■□□ 2.58
Nisch-222ENSMUST00000172142 Zfp644E9QA22 1323 aa31.15■■■□□ 2.58
Nisch-222ENSMUST00000172142 Abcc2Q8VI47 1543 aa31.13■■■□□ 2.57
Nisch-222ENSMUST00000172142 Plekhh2Q8C115 1491 aa31.1■■■□□ 2.57
Nisch-222ENSMUST00000172142 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
Nisch-222ENSMUST00000172142 Abcc5Q9R1X5 1436 aa31.08■■■□□ 2.57
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
Nisch-222ENSMUST00000172142 Soga1E1U8D0 1418 aa31.03■■■□□ 2.56
Nisch-222ENSMUST00000172142 WrnO09053 1401 aa31.02■■■□□ 2.56
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mtus2Q3UHD3 1353 aa31.01■■■□□ 2.55
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pik3c2gO70167 1506 aa30.99■■■□□ 2.55
Nisch-222ENSMUST00000172142 AknaQ80VW7 1404 aa30.95■■■□□ 2.55
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ofd1Q80Z25 1017 aa30.95■■■□□ 2.55
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rgl3Q3UYI5 709 aa30.94■■■□□ 2.54
Nisch-222ENSMUST00000172142 Plekhg5Q66T02 1073 aa30.93■■■□□ 2.54
Nisch-222ENSMUST00000172142 Shroom2A2ALU4 1481 aa30.91■■■□□ 2.54
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pak3Q61036 559 aa30.91■■■□□ 2.54
Nisch-222ENSMUST00000172142 Liat1Q810M6 228 aa30.9■■■□□ 2.54
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dapk1Q80YE7 1442 aa30.89■■■□□ 2.53
Nisch-222ENSMUST00000172142 Neo1P97798 1493 aa30.88■■■□□ 2.53
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ncoa3O09000 1398 aa30.88■■■□□ 2.53
Nisch-222ENSMUST00000172142 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa30.88■■■□□ 2.53
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rundc1Q0VDN7 615 aa30.87■■■□□ 2.53
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
Nisch-222ENSMUST00000172142 Il16O54824 1322 aa30.85■■■□□ 2.53
Nisch-222ENSMUST00000172142 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
Nisch-222ENSMUST00000172142 Card11Q8CIS0 1159 aa30.82■■■□□ 2.52
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
Nisch-222ENSMUST00000172142 Slc4a3P16283 1227 aa30.8■■■□□ 2.52
Nisch-222ENSMUST00000172142 SphkapQ6NSW3 1687 aa30.79■■■□□ 2.52
Nisch-222ENSMUST00000172142 Map3k4O08648 1597 aa30.79■■■□□ 2.52
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa30.78■■■□□ 2.52
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fgd6Q69ZL1 1399 aa30.77■■■□□ 2.52
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa30.77■■■□□ 2.52
Nisch-222ENSMUST00000172142 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
Nisch-222ENSMUST00000172142 Trak1Q6PD31 939 aa30.73■■■□□ 2.51
Nisch-222ENSMUST00000172142 AlkP97793 1621 aa30.73■■■□□ 2.51
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa30.73■■■□□ 2.51
Nisch-222ENSMUST00000172142 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa30.73■■■□□ 2.51
Nisch-222ENSMUST00000172142 L3mbtl2P59178 703 aa30.71■■■□□ 2.51
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ttll5Q8CHB8 1328 aa30.71■■■□□ 2.51
Nisch-222ENSMUST00000172142 Egfem1Q8C088 590 aa30.7■■■□□ 2.51
Nisch-222ENSMUST00000172142 Adcy10Q8C0T9 1614 aa30.7■■■□□ 2.51
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mbd5B1AYB6 1498 aa30.7■■■□□ 2.5
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kif21bQ9QXL1 1668 aa30.69■■■□□ 2.5
Nisch-222ENSMUST00000172142 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa30.68■■■□□ 2.5
Nisch-222ENSMUST00000172142 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mug2P28666 1451 aa30.68■■■□□ 2.5
Nisch-222ENSMUST00000172142 Naip6Q9JIB6 1403 aa30.68■■■□□ 2.5
Nisch-222ENSMUST00000172142 Myom3A2ABU4 1439 aa30.67■■■□□ 2.5
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kcnh8P59111 1102 aa30.61■■■□□ 2.49
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc27Q3V036 639 aa30.6■■■□□ 2.49
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mroh2aD3Z750 1679 aa30.6■■■□□ 2.49
Nisch-222ENSMUST00000172142 Chd1P40201 1711 aa30.6■■■□□ 2.49
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ipo9Q91YE6 1041 aa30.6■■■□□ 2.49
Nisch-222ENSMUST00000172142 Arhgef11Q68FM7 1552 aa30.59■■■□□ 2.49
Nisch-222ENSMUST00000172142 Jph4Q80WT0 628 aa30.59■■■□□ 2.49
Nisch-222ENSMUST00000172142 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rock2P70336 1388 aa30.58■■■□□ 2.49
Nisch-222ENSMUST00000172142 Abcc1O35379 1528 aa30.57■■■□□ 2.48
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa30.57■■■□□ 2.48
Nisch-222ENSMUST00000172142 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
Nisch-222ENSMUST00000172142 Wdr7Q920I9 1489 aa30.55■■■□□ 2.48
Nisch-222ENSMUST00000172142 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.4 ms