RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Primpol	Q6P1E7	537 aa		6.07	□□□□□ -1.44
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam117a	Q7TNF9	451 aa		6.07	□□□□□ -1.44
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc7a3	P70423	618 aa		6.07	□□□□□ -1.44
Casp12-201	ENSMUST00000027009	B4galnt3	Q6L8S8	986 aa		6.07	□□□□□ -1.44
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Neurod2	Q62414	383 aa		6.06	□□□□□ -1.44
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zbtb7b	Q64321	544 aa		6.06	□□□□□ -1.44
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dok7	Q18PE0	504 aa		6.05	□□□□□ -1.44
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stk3	Q9JI10	497 aa		6.05	□□□□□ -1.44
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Uncx	O08934	530 aa		6.04	□□□□□ -1.44
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Supt5h	O55201	1082 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pygb	Q8CI94	843 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atad2	Q8CDM1	1040 aa		6.03	□□□□□ -1.44
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nisch	Q80TM9	1593 aa		6.02	□□□□□ -1.45
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Apba2	P98084	750 aa		6.01	□□□□□ -1.45
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arhgef1	Q61210	920 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pkd2	O35245	966 aa		6	□□□□□ -1.45
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Exoc8	Q6PGF7	716 aa		6	□□□□□ -1.45
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stk25	Q9Z2W1	426 aa		6	□□□□□ -1.45
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc24a3	Q99PD7	645 aa		5.99	□□□□□ -1.45
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clstn1	Q9EPL2	979 aa		5.99	□□□□□ -1.45
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bcl2l13	P59017	434 aa		5.99	□□□□□ -1.45
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Chrm1	P12657	460 aa		5.98	□□□□□ -1.45
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pdap1	Q3UHX2	181 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Crebzf	Q91ZR3	358 aa		5.98	□□□□□ -1.45
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znf330	Q922H9	316 aa		5.97	□□□□□ -1.45
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc85a	Q5SP85	500 aa		5.96	□□□□□ -1.45
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bcan	Q61361	883 aa		5.96	□□□□□ -1.45
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kcnv2	Q8CFS6	562 aa		5.96	□□□□□ -1.45
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dixdc1	Q80Y83	711 aa		5.96	□□□□□ -1.46
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wwc1	Q5SXA9	1104 aa		5.95	□□□□□ -1.46
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Apbb1	Q9QXJ1	710 aa		5.95	□□□□□ -1.46
Casp12-201	ENSMUST00000027009		A0A286YCP9	139 aa		5.95	□□□□□ -1.46
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stk24	Q99KH8	431 aa		5.95	□□□□□ -1.46
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ptma	P26350	111 aa		5.95	□□□□□ -1.46
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pknox2	Q8BG99	474 aa		5.94	□□□□□ -1.46
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Psmd1	Q3TXS7	953 aa		5.93	□□□□□ -1.46
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfp91	Q62511	572 aa		5.93	□□□□□ -1.46
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znf692	Q3U381	531 aa		5.92	□□□□□ -1.46
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zcwpw1	Q6IR42	630 aa		5.92	□□□□□ -1.46
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gopc	Q8BH60	463 aa		5.92	□□□□□ -1.46
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pcdhb17	Q91VD8	799 aa		5.91	□□□□□ -1.46
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mtmr7	Q9Z2C9	660 aa		5.91	□□□□□ -1.46
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wdr66	E9Q743	1299 aa		5.89	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gjc2	Q8BQU6	440 aa		5.89	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Abcc8	B2RUS7	1588 aa		5.88	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cadps	Q80TJ1	1355 aa		5.88	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mier1	Q5UAK0	511 aa		5.88	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	A030003K21Rik	A0A1Y7VIM3	128 aa		5.88	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm6217	A0A1Y7VJK9	128 aa		5.88	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fnbp4	Q6ZQ03	1031 aa		5.88	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rab11fip3	Q8CHD8	1047 aa		5.88	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nap1l5	Q9JJF0	156 aa		5.87	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Abcc9	P70170	1546 aa		5.87	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lmod2	Q3UHZ5	550 aa		5.87	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ndufv2	Q9D6J6	248 aa		5.87	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lmod3	E9QA62	571 aa		5.86	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arih1	Q9Z1K5	555 aa		5.86	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zc3h4	Q6ZPZ3	1304 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cypt1	Q8CH20	168 aa		5.86	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gimap8	Q75N62	688 aa		5.85	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hdac6	Q9Z2V5	1149 aa		5.85	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	4930523C07Rik	E9Q2T4	99 aa		5.85	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aebp1	Q640N1	1128 aa		5.84	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spink5	Q148R4	1017 aa		5.84	□□□□□ -1.47
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Podxl2	Q8CAE9	603 aa		5.83	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sgip1	Q8VD37	806 aa		5.83	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sparcl1	P70663	650 aa		5.83	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rtl5	Q5DTT4	599 aa		5.83	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam50a	Q9WV03	339 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmed8	Q3UHI4	326 aa		5.82	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ermn	Q5EBJ4	281 aa		5.82	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ankrd13a	Q80UP5	588 aa		5.82	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trim26	Q99PN3	545 aa		5.82	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppfia1	B2RXQ2	1266 aa		5.81	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc69	Q3TCJ8	202 aa		5.81	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znf710	Q3U288	666 aa		5.81	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Foxp4	Q9DBY0	795 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hsp90aa1	P07901	733 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmco4	Q91WU4	631 aa		5.81	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kcna1	P16388	495 aa		5.8	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pcmtd1	P59913	357 aa		5.8	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Skor2	A7M7C7	1008 aa		5.8	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Klhl34	A2AI76	644 aa		5.79	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009		E9Q0B3	247 aa		5.79	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Jade2	Q6ZQF7	829 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Robo4	Q8C310	1012 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mink1	Q9JM52	1308 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam43b	A2AM80	330 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	1700006A11Rik	B9EHI3	544 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nrdc	Q8BHG1	1161 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pwp2	Q8BU03	919 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gpr37l1	Q99JG2	481 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tulp1	Q9Z273	543 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mcc	E9PWI3	1003 aa		5.77	□□□□□ -1.49
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Brd1	E9PZ26	1189 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mettl14	Q3UIK4	456 aa		5.77	□□□□□ -1.49
Casp12-201	ENSMUST00000027009	TMEM121B	Q99MX7	572 aa		5.77	□□□□□ -1.49
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tpd52l2	Q9CYZ2	220 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lemd3	Q9WU40	921 aa		5.77	□□□□□ -1.49
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stk10	O55098	966 aa		5.76	□□□□□ -1.49

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