RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636868.1

ATRX-222, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-222	ENST00000636868	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	STK32C	Q86UX6	486 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	CLEC3A	O75596	197 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	PPP2CB	P62714	309 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	PPP2CA	P67775	309 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	PTH1R	Q03431	593 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	CABP7	Q86V35	215 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	PEX11G	Q96HA9	241 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	GSN	P06396	782 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-222	ENST00000636868		F6X3S4	739 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	DGCR2	P98153	550 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	UST	Q9Y2C2	406 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	ARID3C	A6NKF2	412 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	RLBP1	P12271	317 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	L1CAM	P32004	1257 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	ITGA1	P56199	1179 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	ZNF28	P17035	718 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868		H0Y8X5	98 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	PF4	P02776	101 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	RGS19	P49795	217 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	LMNB2	Q03252	620 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	MLEC	Q14165	292 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	FRMD6	Q96NE9	622 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	GMIP	Q9P107	970 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	EXTL1	Q92935	676 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	B4GALT4	O60513	344 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	GNA15	P30679	374 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATRX-222	ENST00000636868	FOXS1	O43638	330 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATRX-222	ENST00000636868	IFNGR1	P15260	489 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATRX-222	ENST00000636868	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATRX-222	ENST00000636868	POU4F1	Q01851	419 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATRX-222	ENST00000636868	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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