RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXC10Q9NYD6 342 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 CELF2O95319 508 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 GJA5P36382 358 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFA8P51970 172 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 OAZ1P54368 228 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 CHADLQ6NUI6 762 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 GADL1Q6ZQY3 521 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D5Q92609 795 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 MYH7BA7E2Y1 1941 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 LAD1O00515 517 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 CFBP00751 764 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR2MP0CAP2 368 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf69Q8N8R5 385 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 CRYGNQ8WXF5 182 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC4DQ8WXI8 215 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM60Q9H2L4 133 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 HPSEQ9Y251 543 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 SPDYE3A6NKU9 549 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 PFKFB1P16118 471 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 MOGSQ13724 837 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP4R3AQ6IN85 833 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 CSRNP2Q9H175 543 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP2A1O14983 1001 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ALAS1P13196 640 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 USP11P51784 963 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF445P59923 1031 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 GHRHRQ02643 423 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 GSE1Q14687 1217 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 NEMFO60524 1076 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 PRPHP41219 470 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 IL17AQ16552 155 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP62CLQ9H1M0 184 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 CLSTN2Q9H4D0 955 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 TDP2O95551 362 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 SREBF1P36956 1147 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 HSD17B4P51659 736 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM132BQ14DG7 1078 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 SPECC1Q5M775 1068 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 CST9Q5W186 159 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 MCF2L2Q86YR7 1114 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0G2JMZ2 1700 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-215ENST00000628018 VWA3AA6NCI4 1184 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 NFIBO00712 420 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 SNAPC2Q13487 334 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 MUM1L1Q5H9M0 696 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 SAMD3Q8N6K7 520 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 SYCE3A1L190 88 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52Z1P0C646 297 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP4P98171 946 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 MOXD1Q6UVY6 613 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 TRERF1Q96PN7 1200 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM13BQ9NYF5 915 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 TRPM7Q96QT4 1865 aa28.25■■■□□ 2.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC37A4O43826 429 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 KINO60870 393 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP3A7P24462 503 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 DTHD1Q6ZMT9 781 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 FCHSD1Q86WN1 690 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 POTEDQ86YR6 584 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 MBOAT7Q96N66 472 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 MTMR9Q96QG7 549 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 RIPK3Q9Y572 518 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF202O95125 648 aa28.23■■■□□ 2.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 SYKP43405 635 aa28.23■■■□□ 2.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 POTEEQ6S8J3 1075 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 LBX2Q6XYB7 198 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX13BQ9BXU2 312 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 TNMDQ9H2S6 317 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 HOMER2Q9NSB8 354 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNH3Q9ULD8 1083 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP3A4P08684 503 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 CAMK4Q16566 473 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 USP49Q70CQ1 688 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-215ENST00000628018 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.113e-8■■□□□ 13.7
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