RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627542.2

PCBP1-AS1-318, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 702 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.53□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 FLRT1Q9NZU1 646 aa10.53□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 FRMPD3Q5JV73 1810 aa10.53□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa10.53□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PIK3CDO00329 1044 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CPLX1O14810 134 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SEPT4O43236 478 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SGPL1O95470 568 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 POLR2MP0CAP2 368 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CYBAP13498 195 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 IFNAR1P17181 557 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 GJA8P48165 433 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 HSD17B4P51659 736 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 FUT2Q10981 343 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 RABEP1Q15276 862 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 MTFR1Q15390 333 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SLC35G1Q2M3R5 365 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 IFFO2Q5TF58 517 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TRIM22Q8IYM9 498 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ANKLE1Q8NAG6 615 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CUL5Q93034 780 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 IWS1Q96ST2 819 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 BACH2Q9BYV9 841 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 UNC93B1Q9H1C4 597 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PFKFB2O60825 505 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CFBP00751 764 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CALML3P27482 149 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CDC27P30260 824 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CYP2C19P33261 490 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ADD1P35611 737 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 RGS19P49795 217 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 AK2P54819 239 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CNTN2Q02246 1040 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NTRK3Q16288 839 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 MCTP2Q6DN12 878 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ARMCX2Q7L311 632 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 FGD4Q96M96 766 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 VTA1Q9NP79 307 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 V9GY48 417 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CENPFP49454 3210 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SOWAHBA6NEL2 793 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ST18O60284 1047 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SCG2P13521 617 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 AKR1A1P14550 325 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 EDNRBP24530 442 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TRIM32Q13049 653 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ACVR2BQ13705 512 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 XRRA1Q6P2D8 792 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SLC30A10Q6XR72 485 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CCDC82Q8N4S0 544 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CCDC148Q8NFR7 591 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TBC1D32Q96NH3 1257 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 DEFB118Q96PH6 123 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 RMDN3Q96TC7 470 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PSTPIP2Q9H939 334 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SH3GLB2Q9NR46 395 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 BARHL2Q9NY43 387 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 OGDHLQ9ULD0 1010 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 FAM184BQ9ULE4 1060 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 LRRC37A2A6NM11 1700 aa10.5□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ESYT2A0FGR8 921 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 OPLAHO14841 1288 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 STAM2O75886 525 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 DEXIO95424 95 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 FOSP01100 380 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 RARBP10826 455 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CNGA1P29973 690 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 GNA11P29992 359 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 MCM2P49736 904 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PDE4DQ08499 809 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ARHGEF16Q5VV41 709 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 IQSEC1Q6DN90 963 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ARRDC4Q8NCT1 418 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 BICD2Q8TD16 824 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 WASF1Q92558 559 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 KIF2CQ99661 725 aa10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms