RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 USP6NLQ92738 828 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 COPB2P35606 906 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 FOSBP53539 338 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 GRB14Q14449 540 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 NTRK3Q16288 839 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 REPS2Q8NFH8 660 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 APBA2Q99767 749 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 TNKSO95271 1327 aa24.65■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 NR1I2O75469 434 aa24.65■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 ADORA2AP29274 412 aa24.65■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.65■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 TRIB2Q92519 343 aa24.65■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.65■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 POLR3EQ9NVU0 708 aa24.65■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 SLC5A4Q9NY91 659 aa24.65■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.65■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 PLA2G6O60733 806 aa24.64■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 YEATS4O95619 227 aa24.64■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 CDC27P30260 824 aa24.64■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.64■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.64■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 SENP2Q9HC62 589 aa24.64■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.64■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC69A6NI79 296 aa24.63■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.63■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 CTAGE5O15320 804 aa24.63■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 PDHBP11177 359 aa24.63■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 KCTD2Q14681 263 aa24.63■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 CCL14Q16627 93 aa24.63■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 PNMA1Q8ND90 353 aa24.63■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 MMP19Q99542 508 aa24.63■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.63■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 ERICH2A1L162 156 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 SLC16A2P36021 539 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 TYRO3Q06418 890 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 A0A1W2PQ27 194 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 A0A1W2PQ64 194 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 A0A1W2PQD8 194 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 ATP2A1O14983 1001 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 PPFIA3O75145 1194 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 OAZ1P54368 228 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM32Q13049 653 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 MICU3Q86XE3 530 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 ANKS1AQ92625 1134 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 ALG1Q9BT22 464 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 RIPK3Q9Y572 518 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 CAVIN2O95810 425 aa24.61■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 GJB1P08034 283 aa24.61■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 HOXC6P09630 235 aa24.61■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 IFNAR1P17181 557 aa24.61■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.61■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 LINC00301Q8NCQ3 95 aa24.61■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.61■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.61■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 RPTORQ8N122 1335 aa24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 SNAP25P60880 206 aa24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 WTAPQ15007 396 aa24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 PPP2R5BQ15173 497 aa24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 CAMK4Q16566 473 aa24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 ADALQ6DHV7 355 aa24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC174Q6PII3 467 aa24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 ENGASEQ8NFI3 743 aa24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 WASF1Q92558 559 aa24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 FAM160A1Q05DH4 1040 aa24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF543Q08ER8 600 aa24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 DEFB118Q96PH6 123 aa24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 COBLO75128 1261 aa24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-210ENST00000619438 FBXO40Q9UH90 709 aa24.59■■□□□ 1.53
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