RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602111.5

FCHO1-236, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 781 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-236ENST00000602111 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 NYAP2Q9P242 653 aa16.64■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 Q9Y3F1 56 aa16.64■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 LCTP09848 1927 aa16.64■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 LINC01553A4QN01 128 aa16.63■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 RASA1P20936 1047 aa16.63■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 ADD2P35612 726 aa16.63■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 OR6J1Q8NGC5 347 aa16.63■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 POTEB3A0JP26 581 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 SNAP25P60880 206 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 ERVK-21P61565 698 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 ZP2Q05996 745 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 BFSP2Q13515 415 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 DUSP28Q4G0W2 176 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 POTEBQ6S5H4 581 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 TRERF1Q96PN7 1200 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 MKNK2Q9HBH9 465 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 VTA1Q9NP79 307 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 TMEM232C9JQI7 657 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 CPT1AP50416 773 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 MUM1L1Q5H9M0 696 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 NSMFQ6X4W1 530 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 ERC1Q8IUD2 1116 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 PRSS33Q8NF86 280 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 C17orf80Q9BSJ5 609 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 WDR11Q9BZH6 1224 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 GJB5O95377 273 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 BMP3P12645 472 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 TCTN1Q2MV58 587 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 SLFN13Q68D06 897 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 NEK9Q8TD19 979 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 CEP95Q96GE4 821 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 MFSD14AQ96MC6 490 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 PAG1Q9NWQ8 432 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 CYP39A1Q9NYL5 469 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 MUTYHQ9UIF7 546 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 MINDY4BA8MYZ0 360 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 ST18O60284 1047 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 PRDM1O75626 825 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 NFRKBQ6P4R8 1299 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 ITPRIPQ8IWB1 547 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 RAD9AQ99638 391 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 BOLA2Q9H3K6 86 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 MYH7P12883 1935 aa16.58■□□□□ 0.25
FCHO1-236ENST00000602111 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 IRS1P35568 1242 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 STAT2P52630 851 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 GPNMBQ14956 572 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 PTGISQ16647 500 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 LRRC8DQ7L1W4 858 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 RHPN1Q8TCX5 695 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.243e-7■■■■□ 23.2
FCHO1-236ENST00000602111 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 CLUL1Q15846 466 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 TKFCQ3LXA3 575 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 TCEAL5Q5H9L2 206 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 IER5LQ5T953 404 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 CEP85Q6P2H3 762 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 ADHFE1Q8IWW8 467 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 CCDC155Q8N6L0 562 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 COPS5Q92905 334 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 FAM86C1Q9NVL1 165 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 FAM50BQ9Y247 325 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 RAD50Q92878 1312 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 NBNO60934 754 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 TTLL1O95922 423 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 SELPP16109 830 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 PTPN5P54829 565 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 PPP2R5BQ15173 497 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 TIGD5Q53EQ6 642 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 AFAP1L1Q8TED9 768 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 CLDND1Q9NY35 253 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 MTMR4Q9NYA4 1195 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 CCPG1Q9ULG6 757 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 TECTAO75443 2155 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 CACNA1AO00555 2505 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 C19orf67A6NJJ6 358 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 GFRA3O60609 400 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 FDX1P10109 184 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 SLC1A4P43007 532 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-236ENST00000602111 PTPROQ16827 1216 aa16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms