RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 VWCEQ96DN2 955 aa30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM227BQ96M60 508 aa30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 HELLSQ9NRZ9 838 aa30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 TOP1P11387 765 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 AKNAD1Q5T1N1 836 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD45Q5TZF3 282 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC30A10Q6XR72 485 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 GPCPD1Q9NPB8 672 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0D9SFI3 127 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 FGAP02671 866 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC4DQ8WXI8 215 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SCLYQ96I15 445 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR11Q9BZH6 1224 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPDC1A2A3K4 754 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 PDHBP11177 359 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 RABGGTBP53611 331 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE1AP54750 535 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 PURAQ00577 322 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 CALML3P27482 149 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC28A3Q9HAS3 691 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR3EQ9NVU0 708 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 CHD9Q3L8U1 2897 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2C9P11712 490 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 IGFBP4P22692 258 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 HAND2P61296 217 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6J1Q8NGC5 347 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-211ENST00000590874 MYL3P08590 195 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CPT1AP50416 773 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF207Q6ZRF8 634 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 THEGQ9P2T0 379 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 TNKSO95271 1327 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 MYOGP15173 224 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF543Q08ER8 600 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMYM6O95789 1325 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBBXA8MT70 800 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 RRP1P56182 461 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS6P62753 249 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 GBF1Q92538 1859 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF10AO00220 468 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 SNHG28P0DPA3 235 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 EDNRBP24530 442 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE4DQ08499 809 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 TTLL4Q14679 1199 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D10CQ8IV04 446 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 ASB2Q96Q27 587 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CRBNQ96SW2 442 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP2R5BQ15173 497 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP2R2DQ66LE6 453 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB128Q7Z7B8 93 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 COPS5Q92905 334 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR19Q8NEZ3 1342 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 MUC3AQ02505 3323 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC28Q96AY4 2481 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PFKMP08237 780 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 NBPF20Q3BBV1 942 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM47CQ5HY64 1035 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC14Q96N46 770 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PNMA2Q9UL42 364 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC171Q6TFL3 1326 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD6Q6ZSS7 791 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 DNERQ8NFT8 737 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 SCFD2Q8WU76 684 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 NEDD4P46934 1319 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 A6NJR5 290 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA8HP0CJ92 632 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 PCP11498 1178 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 USH1GQ495M9 461 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TICAM2Q86XR7 235 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 CPVLQ9H3G5 476 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD50Q92878 1312 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 CHD7Q9P2D1 2997 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 ARIH2O95376 493 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
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