RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 C2orf69Q8N8R5 385 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 NUP133Q8WUM0 1156 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 CEP95Q96GE4 821 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM47Q9BQJ4 181 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 MAF1Q9H063 256 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 BRMS1Q9HCU9 246 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 CLIP2Q9UDT6 1046 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa8.47□□□□□ -1.05
SMAD4-210ENST00000590061 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 H3BQV1 296 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 LILRA1O75019 489 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 DEXIO95424 95 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 BMP2P12643 396 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 CPA1P15085 419 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 AKR1B1P15121 316 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 CALML3P27482 149 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SLC1A4P43007 532 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 GRM4Q14833 912 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 MAP3K11Q16584 847 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ATL3Q6DD88 541 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 CHST3Q7LGC8 479 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 FAM160B2Q86V87 743 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 MICU3Q86XE3 530 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 KLRG1Q96E93 195 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 WRNIP1Q96S55 665 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 FEZ1Q99689 392 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 TMX2Q9Y320 296 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 USP17L10C9JJH3 530 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 CXCL11O14625 94 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SPINT1O43278 529 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 EEF2P13639 858 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 VEGFBP49765 207 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ATP2B2Q01814 1243 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 PPATQ06203 517 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SLFN13Q68D06 897 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 MIGA2Q7L4E1 593 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ERO1BQ86YB8 467 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC83Q8IWF9 413 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC148Q8NFR7 591 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.45□□□□□ -1.06
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SMAD4-210ENST00000590061 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 CDCA5Q96FF9 252 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 TCEANC2Q96MN5 208 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 GBP4Q96PP9 640 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 RRAGCQ9HB90 399 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 TMOD4Q9NZQ9 345 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 FEM1BQ9UK73 627 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 CEP350Q5VT06 3117 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SHTN1A0MZ66 631 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 KLRF2D3W0D1 207 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 F5H6K3 240 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 UPP2O95045 317 aa8.44□□□□□ -1.06
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SMAD4-210ENST00000590061 VSIG8P0DPA2 414 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SNHG28P0DPA3 235 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 BMP3P12645 472 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 KLRC3Q07444 240 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SCRN1Q12765 414 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 STK3Q13188 491 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SEPT2Q15019 361 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 TMTC3Q6ZXV5 915 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 SMC1BQ8NDV3 1235 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 DNAJC18Q9H819 358 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD4-210ENST00000590061 VCPKMTQ9H867 229 aa8.44□□□□□ -1.06
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