RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
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CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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CAPNS1-208ENST00000589162 CALM2P0DP24 149 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 CALM3P0DP25 149 aa6.98□□□□□ -1.29
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CAPNS1-208ENST00000589162 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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CAPNS1-208ENST00000589162 BTBD19C9JJ37 291 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 FKBP1BP68106 108 aa6.97□□□□□ -1.29
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CAPNS1-208ENST00000589162 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 FERMT3Q86UX7 667 aa6.97□□□□□ -1.29
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