RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DPYDQ12882 1025 aa27.11■■□□□ 1.93
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DCAF4Q8WV16 495 aa27.08■■□□□ 1.93
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.07■■□□□ 1.92
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCSER1Q9C0I3 900 aa27.03■■□□□ 1.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NAALADL2Q58DX5 795 aa27.02■■□□□ 1.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VPS33BQ9H267 617 aa27.02■■□□□ 1.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PSTPIP2Q9H939 334 aa27.02■■□□□ 1.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa27.02■■□□□ 1.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TGFB2P61812 414 aa27.02■■□□□ 1.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IKQ13123 557 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa27.02■■□□□ 1.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa27.01■■□□□ 1.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CNTNAP1P78357 1384 aa27.01■■□□□ 1.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC37A4O43826 429 aa27.01■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
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