RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 NELFBQ8WX92 580 aa22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 WDR90Q96KV7 1748 aa22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP17L3A6NCW0 530 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP17L4A6NCW7 530 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 TSPY3P0CV98 308 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 TSPY8P0CW00 308 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 HDXQ7Z353 690 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 DISC1Q9NRI5 854 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-205ENST00000564630 N4BP3O15049 544 aa22.77■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 BAG3O95817 575 aa22.77■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDC25AP30304 524 aa22.77■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP4CP60510 307 aa22.77■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.77■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.77■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 GALNT17Q6IS24 598 aa22.77■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.77■■□□□ 1.23
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CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 MXD3Q9BW11 206 aa22.77■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 POTECB2RU33 542 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERLIN1O75477 346 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 IVLP07476 585 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 EFCC1Q9HA90 598 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 L1RE1Q9UN81 338 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 CYTH3O43739 400 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 TNIP1Q15025 636 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 GRIK5Q16478 980 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNJ18B7U540 433 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 GTF2IP78347 998 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNJ12Q14500 433 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 VPS16Q9H269 839 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 BARHL2Q9NY43 387 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 GDAQ9Y2T3 454 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 STXBP3O00186 592 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRCPP42785 496 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCNN1DP51172 638 aa22.74■■□□□ 1.23
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CCNDBP1-205ENST00000564630 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 GBP3Q9H0R5 595 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 SHTN1A0MZ66 631 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 IL1R1P14778 569 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 SRLQ86TD4 932 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYO1CO00159 1063 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF5CO60282 957 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 LDHCP07864 332 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 RASA1P20936 1047 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM14Q14142 442 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 INF2Q27J81 1249 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 LAD1O00515 517 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A0U1RQJ8 604 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 PP2D1A8MPX8 630 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 H7C1D1 291 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ADSSL1Q8N142 457 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 STX8Q9UNK0 236 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF3CO14782 793 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYL1P05976 194 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 EPS15P42566 896 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 DACT2Q5SW24 774 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTMR7Q9Y216 660 aa22.71■■□□□ 1.23
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