RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRPV1Q8NER1 839 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.825e-6■□□□□ 9.8
CCNDBP1-204ENST00000563065 TINF2Q9BSI4 451 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNF208Q9H0X6 261 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 CFBP00751 764 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 SOX10P56693 466 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 SCRN1Q12765 414 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 COL20A1Q9P218 1284 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 LCTP09848 1927 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 POTEFA5A3E0 1075 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKRD1Q15327 319 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 ME3Q16798 604 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 NECAB1Q8N987 351 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 RGS22Q8NE09 1264 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 RPTORQ8N122 1335 aa20.15■□□□□ 0.82
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CCNDBP1-204ENST00000563065 PKN1Q16512 942 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARMCX2Q7L311 632 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-204ENST00000563065 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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CCNDBP1-204ENST00000563065 CYBAP13498 195 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 CNGA1P29973 690 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 HSD17B4P51659 736 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 MCM3APO60318 1980 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 CPLX1O14810 134 aa20.13■□□□□ 0.81
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CCNDBP1-204ENST00000563065 RABEP1Q15276 862 aa20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 DEFB118Q96PH6 123 aa20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 STXBP3O00186 592 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 CTDNEP1O95476 244 aa20.12■□□□□ 0.81
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CCNDBP1-204ENST00000563065 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
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CCNDBP1-204ENST00000563065 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.12■□□□□ 0.81
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CCNDBP1-204ENST00000563065 ST3GAL1Q11201 340 aa20.11■□□□□ 0.81
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CCNDBP1-204ENST00000563065 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 ASB14A6NK59 587 aa20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 MEIS2O14770 477 aa20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 GJB1P08034 283 aa20.11■□□□□ 0.81
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CCNDBP1-204ENST00000563065 GTF3C6Q969F1 213 aa20.11■□□□□ 0.81
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CCNDBP1-204ENST00000563065 RMDN3Q96TC7 470 aa20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 KATNBL1Q9H079 304 aa20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 BARHL2Q9NY43 387 aa20.11■□□□□ 0.81
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CCNDBP1-204ENST00000563065 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADAMTS3O15072 1205 aa20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACVR2BQ13705 512 aa20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 LHX8Q68G74 356 aa20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 DNERQ8NFT8 737 aa20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 SGPL1O95470 568 aa20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 MORC4Q8TE76 937 aa20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
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