RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561951.5

BBS2-204, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-204	ENST00000561951	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	SGSM2	O43147	1006 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	RAG1	P15918	1043 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951		Q7L0L9	218 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	ABCB11	O95342	1321 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	ERICH2	A1L162	156 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	CTAGE5	O15320	804 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	ITGB8	P26012	769 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	SEC23A	Q15436	765 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	ELP1	O95163	1332 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BBS2-204	ENST00000561951		E7EWF7	191 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	FPGS	Q05932	587 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	FAAP100	Q0VG06	881 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	SHH	Q15465	462 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	FBXO11	Q86XK2	927 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	HOMER1	Q86YM7	354 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	DEFB123	Q8N688	67 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	ARVCF	O00192	962 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	ZEB2	O60315	1214 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	PSMC6	P62333	389 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	WTAP	Q15007	396 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	TOX2	Q96NM4	488 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	TBX21	Q9UL17	535 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951		B4DLN1	442 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	CFB	P00751	764 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	MYL3	P08590	195 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	GRM4	Q14833	912 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	DNER	Q8NFT8	737 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	TBC1D5	Q92609	795 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	AMN	Q9BXJ7	453 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	CABYR	O75952	493 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	EDNRB	P24530	442 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	CPT1A	P50416	773 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	EPHB4	P54760	987 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	NKX3-2	P78367	333 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	ITGA7	Q13683	1181 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	GPR153	Q6NV75	609 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	COPS5	Q92905	334 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	FAM161B	Q96MY7	647 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	COL20A1	Q9P218	1284 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951		Q9Y3F1	56 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS2-204	ENST00000561951	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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