RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561718.5

RNPS1-205, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,806 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-205ENST00000561718 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 USP17L19D6RCP7 530 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 USP17L20D6RJB6 530 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 MEIS2O14770 477 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 USP17L24Q0WX57 530 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 USH1GQ495M9 461 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 CABP7Q86V35 215 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 LPAR1Q92633 364 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 DOCK1Q14185 1865 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 SLC37A4O43826 429 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 EDIL3O43854 480 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 CDC25AP30304 524 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 PIK3CDO00329 1044 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 TECP42680 631 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 TXKP42681 527 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 SEMA3FQ13275 785 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 PDIA5Q14554 519 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 RMND1Q9NWS8 449 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 PP2D1A8MPX8 630 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 SNAP25P60880 206 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-205ENST00000561718 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 DRC7Q8IY82 874 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 CALML4Q96GE6 196 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 CYP3A7P24462 503 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 SPC24Q8NBT2 197 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 KIFC2Q96AC6 838 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 MBOAT7Q96N66 472 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 MTRQ99707 1265 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 CLCN1P35523 988 aa20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 SREBF1P36956 1147 aa20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 ARHGAP4P98171 946 aa20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 PLCG1P19174 1290 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 STK17AQ9UEE5 414 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.842e-8■■□□□ 12
RNPS1-205ENST00000561718 ABCB11O95342 1321 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 OPLAHO14841 1288 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 MARCH6O60337 910 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 CASP1P29466 404 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 USP14P54578 494 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 CUL4BQ13620 913 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 STAMQ92783 540 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 GGA3Q9NZ52 723 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 KRT79Q5XKE5 535 aa20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 HAS1Q92839 578 aa20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 TBX3O15119 743 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 SLC26A4O43511 780 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 INPP5BP32019 993 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 AMPD3Q01432 767 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 KCNB1Q14721 858 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 CCDC174Q6PII3 467 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 WDR18Q9BV38 432 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 CBFA2T2O43439 604 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 CIITAP33076 1130 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 Q4G0T1 1027 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-205ENST00000561718 PNMA2Q9UL42 364 aa20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms