RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560829.5

SNX1-211, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SNX1, Length 1,869 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-211ENST00000560829 FEZ1Q99689 392 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 CUEDC2Q9H467 287 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 GGA3Q9NZ52 723 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 PP2D1A8MPX8 630 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 CDC25AP30304 524 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 INPP5BP32019 993 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 ZNF75DP51815 510 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 PDIA5Q14554 519 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 USH1GQ495M9 461 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 MTRQ99707 1265 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 WDR18Q9BV38 432 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 DACH1Q9UI36 760 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-211ENST00000560829 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 MYL1P05976 194 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 SREBF1P36956 1147 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 STAT6P42226 847 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 AFMP43652 599 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 ISM2Q6H9L7 571 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 CABP7Q86V35 215 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 KIFC2Q96AC6 838 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 CDC25BP30305 580 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 TECP42680 631 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 HAS1Q92839 578 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 RAB34Q9BZG1 259 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 UTRNP46939 3433 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 ESPNB1AK53 854 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 ABCB11O95342 1321 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 TXKP42681 527 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 USP14P54578 494 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 ARHGAP4P98171 946 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 MYL5Q02045 173 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 SEMA3FQ13275 785 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 TRIM5Q9C035 493 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 RNF181Q9P0P0 153 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 CYP3A4P08684 503 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 CIITAP33076 1130 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 TPM4P67936 248 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 KLRG1Q96E93 195 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 WRNIP1Q96S55 665 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 TBX3O15119 743 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 ICAM1P05362 532 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 PTPRAP18433 802 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 Q4G0T1 1027 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 C12orf42Q96LP6 360 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 HSD3B7Q9H2F3 369 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 ZNF536O15090 1300 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 PLCG1P19174 1290 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 VCAM1P19320 739 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 CASP1P29466 404 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 GHRHRQ02643 423 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 CUL4BQ13620 913 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 CCDC174Q6PII3 467 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 LDHDQ86WU2 507 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 CALML4Q96GE6 196 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 PICK1Q9NRD5 415 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 RMND1Q9NWS8 449 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 SLC26A4O43511 780 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 TPM3P06753 285 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 POLR2MP0CAP2 368 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX1-211ENST00000560829 BACE1P56817 501 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms