RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553190.5

MYBPC1-223, Transcript of myosin binding protein C, slow type, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MYBPC1, Length 3,777 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYBPC1-223	ENST00000553190	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190		M0R2N6	131 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	AFM	P43652	599 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	CABP7	Q86V35	215 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	LDHD	Q86WU2	507 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	DRC7	Q8IY82	874 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	EPSTI1	Q96J88	318 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	GLTPD2	A6NH11	291 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	ALAS1	P13196	640 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	PTPRA	P18433	802 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	KLRG1	Q96E93	195 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	CUEDC2	Q9H467	287 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	TEC	P42680	631 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	ARHGAP4	P98171	946 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	ICAM1	P05362	532 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	TRIM5	Q9C035	493 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	CBX8	Q9HC52	389 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	VCAM1	P19320	739 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	HMGCS2	P54868	508 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	GRIN1	Q05586	938 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	PNOC	Q13519	176 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	STIM1	Q13586	685 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	COG2	Q14746	738 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	MLKL	Q8NB16	471 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	PDIA5	Q14554	519 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	PRR16	Q569H4	304 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	TDP2	O95551	362 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	MYL1	P05976	194 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	TPM3	P06753	285 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	ISM2	Q6H9L7	571 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	ILDR2	Q71H61	639 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	FAM20A	Q96MK3	541 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	GSDMA	Q96QA5	445 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	ADM5	C9JUS6	153 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	PIK3CD	O00329	1044 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	TBX3	O15119	743 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	PLS1	Q14651	629 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	USP49	Q70CQ1	688 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	SV2B	Q7L1I2	683 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	LUZP1	Q86V48	1076 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	POTED	Q86YR6	584 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	DISC1	Q9NRI5	854 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		7.42	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	SREBF1	P36956	1147 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	7.41	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	NSMF	Q6X4W1	530 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	ERO1B	Q86YB8	467 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	PAGE5	Q96GU1	130 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		7.41	□□□□□ -1.22
MYBPC1-223	ENST00000553190	STK17A	Q9UEE5	414 aa		7.41	□□□□□ -1.22

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