RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 ADAMTS4O75173 837 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 CST5P28325 142 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 HSD17B4P51659 736 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 LRRC41Q15345 812 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC144BQ3MJ40 725 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC30A10Q6XR72 485 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 NFXL1Q6ZNB6 911 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 FANCBQ8NB91 859 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 Q9Y3F1 56 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 PSMA5P28066 241 aa27■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 PPP2R5BQ15173 497 aa27■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 C1orf53Q5VUE5 145 aa27■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 IQSEC1Q6DN90 963 aa27■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 APOA5Q6Q788 366 aa27■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 KLHDC9Q8NEP7 349 aa27■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 NUP133Q8WUM0 1156 aa27■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 PIGSQ96S52 555 aa27■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa27■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa27■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 TAPT1Q6NXT6 567 aa26.99■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 RNF180Q86T96 592 aa26.99■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.99■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 NR2E3Q9Y5X4 410 aa26.99■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 GJA9P57773 515 aa26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 IWS1Q96ST2 819 aa26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 MYL10Q9BUA6 226 aa26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 LRRC2Q9BYS8 371 aa26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 PHF24Q9UPV7 400 aa26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 KBTBD13C9JR72 458 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 CALML3P27482 149 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 EVCP57679 992 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 SNX17Q15036 470 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 TEX2Q8IWB9 1127 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 TBC1D5Q92609 795 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 DPF3Q92784 378 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 IL17RAQ96F46 866 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 DNAH12Q6ZR08 3092 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 NID2Q14112 1375 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 ADCY6O43306 1168 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDSP2-203ENST00000547701 MOXD2PA6NHM9 499 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 RPS6KB1P23443 525 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 ANO1Q5XXA6 986 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 EVI5O60447 810 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 TNFAIP2Q03169 654 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 HOMER1Q86YM7 354 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 COL20A1Q9P218 1284 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 CTAGE5O15320 804 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 ZBTB43O43298 467 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 PLEKHA8P1O95397 391 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 PGK1P00558 417 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 FUT2Q10981 343 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 DUSP28Q4G0W2 176 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 TAAR1Q96RJ0 339 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 SPC25Q9HBM1 224 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 ANAPC15P60006 121 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 RUFY3Q7L099 469 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 MICU3Q86XE3 530 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 RMDN3Q96TC7 470 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 PIK3CDO00329 1044 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 CFBP00751 764 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 ADCYAP1R1P41586 468 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 PDE4DQ08499 809 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 Q6ZUG5 572 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 H0YGN5 161 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 SMPD1P17405 629 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 RXRAP19793 462 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 CASTP20810 708 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CTDSP2-203ENST00000547701 LRRC26Q2I0M4 334 aa26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms