RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 TMTC3Q6ZXV5 915 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 WDR18Q9BV38 432 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 TMEM260Q9NX78 707 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 TFRCP02786 760 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 PTMSP20962 102 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 ADORA2AP29274 412 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 KRT2P35908 639 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 TXKP42681 527 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 IGBP1P78318 339 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 NR5A1Q13285 461 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 PTPN18Q99952 460 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 CASZ1Q86V15 1759 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 MYH13Q9UKX3 1938 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 ZMYM6O95789 1325 aa9.96□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 TLR2O60603 784 aa9.96□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 GTF3C6Q969F1 213 aa9.96□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 FBXO40Q9UH90 709 aa9.96□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 DUOX1Q9NRD9 1551 aa9.96□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 TMEM132BQ14DG7 1078 aa9.96□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 MAEAQ7L5Y9 396 aa9.96□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 ERO1AQ96HE7 468 aa9.96□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa9.96□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.96□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.96□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 RIPK3Q9Y572 518 aa9.96□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.96□□□□□ -0.81
GGA3-202ENST00000538886 ZNF831Q5JPB2 1677 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 TERF1P54274 439 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 GRM4Q14833 912 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 NLRX1Q86UT6 975 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 AP5M1Q9H0R1 490 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 ADCY3O60266 1144 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 MARK3P27448 753 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 BTBD7Q9P203 1132 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 MYPNQ86TC9 1320 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 MYH2Q9UKX2 1941 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 STX6O43752 255 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 PRKCZQ05513 592 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 GNPTABQ3T906 1256 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 TICAM2Q86XR7 235 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 MAD2L2Q9UI95 211 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 ABCB11O95342 1321 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 MUM1L1Q5H9M0 696 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 MB21D1Q8N884 522 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 TIGD1Q96MW7 591 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 PFKFB2O60825 505 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 SEC23AQ15436 765 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 BLIDQ8IZY5 108 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 GINM1Q9NU53 330 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.821e-9■■■□□ 18.3
GGA3-202ENST00000538886 MAPK4P31152 587 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 RGS2P41220 211 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 GPR142Q7Z601 462 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 TAAR1Q96RJ0 339 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 PPP1R16BQ96T49 567 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 A0A087WWV3 80 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 SPECC1Q5M775 1068 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 SLC30A10Q6XR72 485 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 ANKRD23Q86SG2 305 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 FOXN1O15353 648 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 SLC25A27O95847 323 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 IFNAR1P17181 557 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 CYP4A11Q02928 519 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 PPP2R5BQ15173 497 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 GNASQ5JWF2 1037 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 TNS4Q8IZW8 715 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 TBCKQ8TEA7 893 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 ZNF112Q9UJU3 913 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-202ENST00000538886 RASSF10A6NK89 507 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms