RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 POLKQ9UBT6 870 aa10.02□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 FGRP09769 529 aa10.01□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 ST13P50502 369 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 Q8N3U1 123 aa10.01□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 GPRASP2Q96D09 838 aa10.01□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 OSBPL2Q9H1P3 480 aa10.01□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 RPS12P25398 132 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 INHBEP58166 350 aa10□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 ERMP1Q7Z2K6 904 aa10□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa10□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 NGEFQ8N5V2 710 aa10□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 MYLIPQ8WY64 445 aa10□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 LRFN3Q9BTN0 628 aa10□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 CARD11Q9BXL7 1154 aa10□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa10□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 FZD1Q9UP38 647 aa10□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 LAMB1P07942 1786 aa10□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 HEG1Q9ULI3 1381 aa10□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 RNMTO43148 476 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 CCL5P13501 91 aa9.99□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 SYN1P17600 705 aa9.99□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 MRE11P49959 708 aa9.99□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 HLFQ16534 295 aa9.99□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 SUPT20HQ8NEM7 779 aa9.99□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 OR13H1Q8NG92 308 aa9.99□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 RBSNQ9H1K0 784 aa9.99□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa9.99□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 EREGO14944 169 aa9.98□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 CCDC184Q52MB2 194 aa9.98□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 SDE2Q6IQ49 451 aa9.98□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.98□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 DBNDD1Q9H9R9 158 aa9.98□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.98□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 C5orf42Q9H799 3197 aa9.98□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 CHD8Q9HCK8 2581 aa9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 CTGFP29279 349 aa9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 TCIRG1Q13488 830 aa9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 GRM2Q14416 872 aa9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 C7orf61Q8IZ16 206 aa9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 IL22RA1Q8N6P7 574 aa9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 WNK4Q96J92 1243 aa9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 TESK2Q96S53 571 aa9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 CHRDQ9H2X0 955 aa9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 CNTN3Q9P232 1028 aa9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.97□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 CACNA1BQ00975 2339 aa9.96□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 TAF1P21675 1872 aa9.96□□□□□ -0.81
LMO3-216ENST00000537568 F6X3S4 739 aa9.96□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 DEKP35659 375 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 RRP1P56182 461 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 PRKG1Q13976 671 aa9.96□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.96□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 IGF2-ASQ6U949 168 aa9.96□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.96□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 TP53INP1Q96A56 240 aa9.96□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 SPON2Q9BUD6 331 aa9.96□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa9.96□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 VIL1P09327 827 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 GSTT1P30711 240 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 ATP11AP98196 1134 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 RNF208Q9H0X6 261 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 ZNF652Q9Y2D9 606 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 ABCC4O15439 1325 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 SCN9AQ15858 1988 aa9.95□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 SGPL1O95470 568 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 NOS3P29474 1203 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 HYAL2Q12891 473 aa9.94□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LMO3-216ENST00000537568 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms