RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
ACER3-211ENST00000531461 GPCPD1Q9NPB8 672 aa28.23■■■□□ 2.11
ACER3-211ENST00000531461 GRIN2DO15399 1336 aa28.22■■■□□ 2.11
ACER3-211ENST00000531461 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
ACER3-211ENST00000531461 DNAJB2P25686 324 aa28.22■■■□□ 2.11
ACER3-211ENST00000531461 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.22■■■□□ 2.11
ACER3-211ENST00000531461 DGKHQ86XP1 1220 aa28.22■■■□□ 2.11
ACER3-211ENST00000531461 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa28.22■■■□□ 2.11
ACER3-211ENST00000531461 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
ACER3-211ENST00000531461 MYLIPQ8WY64 445 aa28.22■■■□□ 2.11
ACER3-211ENST00000531461 ESR2Q92731 530 aa28.22■■■□□ 2.11
ACER3-211ENST00000531461 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
ACER3-211ENST00000531461 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa28.21■■■□□ 2.11
ACER3-211ENST00000531461 MAF1Q9H063 256 aa28.21■■■□□ 2.11
ACER3-211ENST00000531461 VCANP13611 3396 aa28.2■■■□□ 2.11
ACER3-211ENST00000531461 PTPDC1A2A3K4 754 aa28.2■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 NUCB1Q02818 461 aa28.2■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 ZNF213O14771 459 aa28.19■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 PTGS1P23219 599 aa28.19■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 CCDC178Q5BJE1 867 aa28.19■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 TMEM63BQ5T3F8 832 aa28.19■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 RNF207Q6ZRF8 634 aa28.19■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 DNERQ8NFT8 737 aa28.19■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 WDR11Q9BZH6 1224 aa28.19■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 HIPK3Q9H422 1215 aa28.19■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 IL23AQ9NPF7 189 aa28.19■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 NEDD4P46934 1319 aa28.18■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 FOSL2P15408 326 aa28.18■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 EDNRBP24530 442 aa28.18■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.18■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 SLC30A10Q6XR72 485 aa28.18■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 ZNF365Q70YC5 407 aa28.18■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 RGS22Q8NE09 1264 aa28.18■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
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ACER3-211ENST00000531461 HERVK_113Q902F9 699 aa28.17■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 ANKS1AQ92625 1134 aa28.17■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 TIFAQ96CG3 184 aa28.17■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 ZNF576Q9H609 170 aa28.17■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 POLR3EQ9NVU0 708 aa28.17■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa28.17■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 HIP1O00291 1037 aa28.16■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 B4GALT4O60513 344 aa28.16■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 IGHDP01880 384 aa28.16■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 CALML3P27482 149 aa28.16■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 CPT1AP50416 773 aa28.16■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 IQCA1Q86XH1 822 aa28.16■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 ACRP10323 421 aa28.15■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 GRIN2CQ14957 1233 aa28.15■■■□□ 2.1
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ACER3-211ENST00000531461 DSCC1Q9BVC3 393 aa28.15■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 PBX4Q9BYU1 374 aa28.15■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 MYO9BQ13459 2157 aa28.14■■■□□ 2.1
ACER3-211ENST00000531461 B4DLN1 442 aa28.14■■■□□ 2.1
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ACER3-211ENST00000531461 UMODL1Q5DID0 1318 aa28.14■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 PDE4DQ08499 809 aa28.13■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 PNMA1Q8ND90 353 aa28.13■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 SCFD2Q8WU76 684 aa28.13■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa28.13■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 MYH6P13533 1939 aa28.13■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 KDM4AO75164 1064 aa28.12■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 FGBP02675 491 aa28.12■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa28.12■■■□□ 2.09
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ACER3-211ENST00000531461 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 WNT8AQ9H1J5 351 aa28.12■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 RAD50Q92878 1312 aa28.12■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 GOLGA8HP0CJ92 632 aa28.11■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 OR6J1Q8NGC5 347 aa28.11■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
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ACER3-211ENST00000531461 CHD9Q3L8U1 2897 aa28.1■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 A6NJR5 290 aa28.1■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 GRXCR1A8MXD5 290 aa28.1■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 KPNA6O60684 536 aa28.1■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 RAB30Q15771 203 aa28.1■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 ASPRV1Q53RT3 343 aa28.1■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 UBA5Q9GZZ9 404 aa28.1■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 KAT14Q9H8E8 782 aa28.1■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 CTNNA3Q9UI47 895 aa28.1■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 PBX2P40425 430 aa28.09■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 CCL23P55773 120 aa28.09■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 USH1GQ495M9 461 aa28.09■■■□□ 2.09
ACER3-211ENST00000531461 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
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