RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	HSD3B2	P26439	372 aa		5.54	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNC1	P48547	511 aa		5.54	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	NCKAP1L	P55160	1127 aa		5.54	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	KIR3DS1	Q14943	382 aa		5.54	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		5.54	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	MKL1	Q969V6	931 aa		5.54	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		5.54	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		5.54	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		5.54	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	CHST7	Q9NS84	486 aa		5.54	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		5.54	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		5.54	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		5.54	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PQH9	124 aa		5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	CLEC3A	O75596	197 aa		5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	PFKL	P17858	780 aa		5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	GUCY2C	P25092	1073 aa		5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	KRTAP10-2	P60368	255 aa		5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	NUP43	Q8NFH3	380 aa		5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		5.53	□□□□□ -1.52
FAM49B-222	ENST00000522702	MEIS1	O00470	390 aa		5.52	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	RASA3	Q14644	834 aa		5.52	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	NR1I3	Q14994	352 aa		5.52	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC9A7	Q96T83	725 aa		5.52	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	BDH2	Q9BUT1	245 aa		5.52	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		5.52	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		5.52	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	INSRR	P14616	1297 aa		5.51	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	CAP1	Q01518	475 aa		5.51	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	EFEMP1	Q12805	493 aa		5.51	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	DDR2	Q16832	855 aa		5.51	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	UBXN11	Q5T124	520 aa		5.51	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		5.51	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		5.51	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR20	Q99678	358 aa		5.51	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	PALD1	Q9ULE6	856 aa		5.51	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		5.51	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PQJ5	194 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	FFAR3	O14843	346 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	VAV1	P15498	845 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	BMP8B	P34820	402 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	CCNF	P41002	786 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	MAPKAPK2	P49137	400 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	SLURP1	P55000	103 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	RTP5	Q14D33	572 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	RPTN	Q6XPR3	784 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	CERS3	Q8IU89	383 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	USP40	Q9NVE5	1235 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	SNTG2	Q9NY99	539 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		5.5	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP2R5E	Q16537	467 aa		5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	FXN	Q16595	210 aa		5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	JAML	Q86YT9	394 aa		5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		5.49	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702		B2RBV5	119 aa		5.48	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702		K7ESM1	405 aa		5.48	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	ENPP3	O14638	875 aa		5.48	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	DNAJC6	O75061	913 aa		5.48	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF205	O95201	554 aa		5.48	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	LIMS1	P48059	325 aa		5.48	□□□□□ -1.53
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53

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