RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TMEM240Q5SV17 173 aa19.88■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 SLC30A10Q6XR72 485 aa19.88■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 ESR2Q92731 530 aa19.88■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 TMEM265A0A087WTH1 108 aa19.87■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 CYP2C18P33260 490 aa19.87■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 PSMC6P62333 389 aa19.87■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 DUSP28Q4G0W2 176 aa19.87■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 RNF207Q6ZRF8 634 aa19.87■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 EXOC6Q8TAG9 804 aa19.87■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa19.87■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 PNMA2Q9UL42 364 aa19.87■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa19.86■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA8HP0CJ92 632 aa19.86■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 DNAJB2P25686 324 aa19.86■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 ZNF365Q70YC5 407 aa19.86■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 DGKHQ86XP1 1220 aa19.86■□□□□ 0.77
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HERC3-211ENST00000513325 TRPV6Q9H1D0 765 aa19.86■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 CPVLQ9H3G5 476 aa19.86■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 WDR19Q8NEZ3 1342 aa19.85■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 KDM4AO75164 1064 aa19.85■□□□□ 0.77
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HERC3-211ENST00000513325 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa19.85■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 UBA5Q9GZZ9 404 aa19.85■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 HIPK3Q9H422 1215 aa19.85■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 UMODL1Q5DID0 1318 aa19.84■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 A0A0C4DFX4 3053 aa19.84■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 GRXCR1A8MXD5 290 aa19.84■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 B4GALT4O60513 344 aa19.84■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 FOSL2P15408 326 aa19.84■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 PDE4DQ08499 809 aa19.84■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 GRIN2CQ14957 1233 aa19.84■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 USH1GQ495M9 461 aa19.84■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 RASIP1Q5U651 963 aa19.84■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 IL23AQ9NPF7 189 aa19.84■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 B4E1Z4 1266 aa19.83■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 HIP1O00291 1037 aa19.83■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 IQCA1Q86XH1 822 aa19.83■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 PNMA1Q8ND90 353 aa19.83■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 TIFAQ96CG3 184 aa19.83■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 ZNF576Q9H609 170 aa19.83■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 MYL3P08590 195 aa19.82■□□□□ 0.76
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HERC3-211ENST00000513325 CCL23P55773 120 aa19.82■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 CCDC178Q5BJE1 867 aa19.82■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 DNERQ8NFT8 737 aa19.82■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 OR6J1Q8NGC5 347 aa19.82■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 ANKS1AQ92625 1134 aa19.82■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
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HERC3-211ENST00000513325 PBX4Q9BYU1 374 aa19.82■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 KAT14Q9H8E8 782 aa19.82■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 POLR3EQ9NVU0 708 aa19.82■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 FGBP02675 491 aa19.81■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 EDNRBP24530 442 aa19.81■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 NT5C2P49902 561 aa19.81■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 CPT1AP50416 773 aa19.81■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 PURAQ00577 322 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 SCFD2Q8WU76 684 aa19.81■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 HERVK_113Q902F9 699 aa19.81■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 WNT8AQ9H1J5 351 aa19.81■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 ZSWIM5Q9P217 1185 aa19.81■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 PPP2R5BQ15173 497 aa19.8■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 RGS22Q8NE09 1264 aa19.8■□□□□ 0.76
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HERC3-211ENST00000513325 COPS5Q92905 334 aa19.8■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 LAMA4Q16363 1823 aa19.8■□□□□ 0.76
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HERC3-211ENST00000513325 B4DLN1 442 aa19.79■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP19.79■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 OTOP2Q7RTS6 562 aa19.79■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 ADGRF4Q8IZF3 695 aa19.79■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 CTNNA3Q9UI47 895 aa19.79■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 TNKSO95271 1327 aa19.78■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 TXNP10599 105 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 CYP2C9P11712 490 aa19.78■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 ASPRV1Q53RT3 343 aa19.78■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 SCLYQ96I15 445 aa19.78■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 KRT23Q9C075 422 aa19.78■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 IL25Q9H293 177 aa19.78■□□□□ 0.76
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