RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498694.1

CTPS1-212, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 599 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-212ENST00000498694 BRPF3Q9ULD4 1205 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 POLIQ9UNA4 740 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF532Q9HCE3 1301 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 TRPM7Q96QT4 1865 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 FAM181BA6NEQ2 426 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 A6NHS1 94 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 RASSF10A6NK89 507 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 M0R2C6 588 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 WNT10BO00744 389 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 OIP5O43482 229 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 NDUFB5O43674 189 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 FZD6O60353 706 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 SIN3BO75182 1162 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 CDC45O75419 566 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 AMPD1P23109 780 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 CHMLP26374 656 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 EPS15P42566 896 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 BTDP43251 543 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 MAP3K12Q12852 859 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 CFAP100Q494V2 611 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 HHIPL2Q6UWX4 724 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 FCHSD1Q86WN1 690 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 CERS3Q8IU89 383 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 LCORLQ8N3X6 602 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 MAGEB6Q8N7X4 407 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 GALNT6Q8NCL4 622 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 NEDD1Q8NHV4 660 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 EDARADDQ8WWZ3 215 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 TEKT1Q969V4 418 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 FAM227BQ96M60 508 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 MRIQ9BWK5 157 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.631e-6■■□□□ 12.1
CTPS1-212ENST00000498694 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 BCL11AQ9H165 835 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 MYOZ2Q9NPC6 264 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 GGA3Q9NZ52 723 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 RAI14Q9P0K7 980 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 ZFATQ9P243 1243 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 PGAP2Q9UHJ9 254 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 FLT1P17948 1338 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 CCDC171Q6TFL3 1326 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 CNTNAP1P78357 1384 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 LOC285556D6RIA3 1793 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 MYH8P13535 1937 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 PLIN4Q96Q06 1357 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 F8W031 263 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 HIP1O00291 1037 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 FOXN1O15353 648 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 SGSM2O43147 1006 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 GPAA1O43292 621 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 MBD4O95243 580 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 TCF3P15923 654 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 VAMP1P23763 118 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 EPHX2P34913 555 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 ADH7P40394 386 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 GSTO1P78417 241 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 ARHGAP4P98171 946 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF438Q7Z4V0 828 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 RILPL2Q969X0 211 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 IDI2Q9BXS1 227 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 EFCC1Q9HA90 598 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 C11orf16Q9NQ32 467 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 ENAMQ9NRM1 1142 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 LRP2BPQ9P2M1 347 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 HACL1Q9UJ83 578 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 HDAC9Q9UKV0 1011 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-212ENST00000498694 PTPRFP10586 1907 aa4.84□□□□□ -1.64
CTPS1-212ENST00000498694 PHIPQ8WWQ0 1821 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-212ENST00000498694 A0A0G2JMZ2 1700 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-212ENST00000498694 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-212ENST00000498694 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-212ENST00000498694 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-212ENST00000498694 SHISA8B8ZZ34 492 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-212ENST00000498694 MMP20O60882 483 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-212ENST00000498694 PSAPP07602 524 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-212ENST00000498694 EPXP11678 715 aa4.83□□□□□ -1.64
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