RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498478.1

ITGB6-210, Transcript of integrin subunit beta 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB6, Length 705 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6-210ENST00000498478 STRN3Q13033 797 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 GAB4Q2WGN9 574 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 DIO2Q92813 273 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 GPR27Q9NS67 375 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 MSCO60682 206 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 IGLV1-40P01703 118 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 KCNA6P17658 529 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 TESK1Q15569 626 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 DUSP13Q9UII6 198 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 B4E1Z4 1266 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 NPTXRO95502 500 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 EYA4O95677 639 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 S100BP04271 92 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 APPP05067 770 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 PAMP19021 973 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 PIK3R6Q5UE93 754 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 ABHD17CQ6PCB6 329 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 CPEP16870 476 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 NAT1P18440 290 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 FSTP19883 344 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 LTKP29376 864 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 CLCN7P51798 805 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 KCNAB2Q13303 367 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 INF2Q27J81 1249 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 IQCEQ6IPM2 695 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 ZPBP2Q6X784 338 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 LBX2Q6XYB7 198 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 RNF111Q6ZNA4 994 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 CREG2Q8IUH2 290 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 WNK4Q96J92 1243 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 PTCHD1Q96NR3 888 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 SAMD15Q9P1V8 674 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 ALG1L2C9J202 215 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 CYP26A1O43174 497 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 DOC2BQ14184 412 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 DHCR24Q15392 516 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 MBLAC2Q68D91 279 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 NETO1Q8TDF5 533 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 CEP89Q96ST8 783 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 MMP19Q99542 508 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 ARVCFO00192 962 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 GSC2O15499 205 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 IGSF22Q8N9C0 903 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 ALG1Q9BT22 464 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 TMEM82A0PJX8 343 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 ESR1P03372 595 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 PMLP29590 882 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 GUCY2FP51841 1108 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 EGR3Q06889 387 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 PAK1Q13153 545 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 LAPTM5Q13571 262 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 NAT16Q8N8M0 369 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 CKMP06732 381 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGB6-210ENST00000498478 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms