RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PQY0	241 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PRG0	241 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	RAD21	O60216	631 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR37L1	O60883	481 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A27	O95847	323 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHA2	P01877	340 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC174	Q6PII3	467 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	EYS	Q5T1H1	3165 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	PGK2	P07205	417 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	AKR1A1	P14550	325 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ICA1	Q05084	483 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	KIFC2	Q96AC6	838 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ITPKC	Q96DU7	683 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TINF2	Q9BSI4	451 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TNN	Q9UQP3	1299 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	THEG	Q9P2T0	379 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	RLF	Q13129	1914 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	IGFBP4	P22692	258 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ACLY	P53396	1101 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	GABPA	Q06546	454 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	AACS	Q86V21	672 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH23	Q9H251	3354 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	MYH1	P12882	1939 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ESPN	B1AK53	854 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMP1	P01033	207 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	STAT3	P40763	770 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	FAAP100	Q0VG06	881 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TOX2	Q96NM4	488 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	SPC25	Q9HBM1	224 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	MSRA	Q9UJ68	235 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2D6	P10635	497 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	AKR1B1	P15121	316 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	COPB2	P35606	906 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNA10	Q16322	511 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.03	□□□□□ -0.32

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