RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 IRAK3Q9Y616 596 aa7.39□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 EFEMP2O95967 443 aa7.38□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 SDHBP21912 280 aa7.38□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 SCRN1Q12765 414 aa7.38□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.38□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.38□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.38□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.38□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.38□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.38□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 N4BP3O15049 544 aa7.37□□□□□ -1.23
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RBM39-241ENST00000496183 DBHP09172 617 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 PFKLP17858 780 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 HOXC12P31275 282 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 KIR3DS1Q14943 382 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 RPTNQ6XPR3 784 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 SIAH1Q8IUQ4 282 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 MMP19Q99542 508 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 NACADO15069 1562 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 IQCA1LA6NCM1 817 aa7.36□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 MYO1BO43795 1136 aa7.36□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 GJB6O95452 261 aa7.36□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 KRT1P04264 644 aa7.36□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 CFPP27918 469 aa7.36□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.36□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 COPS5Q92905 334 aa7.36□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 B2RBV5 119 aa7.35□□□□□ -1.23
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RBM39-241ENST00000496183 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 MSL3P1P0C860 447 aa7.35□□□□□ -1.23
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RBM39-241ENST00000496183 TACR1P25103 407 aa7.35□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 GTF2A2P52657 109 aa7.35□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.35□□□□□ -1.23
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RBM39-241ENST00000496183 MZB1Q8WU39 189 aa7.35□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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RBM39-241ENST00000496183 ATP2B1P20020 1258 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 KCNJ6P48051 423 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 KCNAB2Q13303 367 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 SLC9A5Q14940 896 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 DDR2Q16832 855 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-241ENST00000496183 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.34□□□□□ -1.23
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RBM39-241ENST00000496183 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.34□□□□□ -1.23
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RBM39-241ENST00000496183 ZBTB7AO95365 584 aa7.33□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 THBDP07204 575 aa7.33□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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RBM39-241ENST00000496183 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.33□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 C7orf72A4D263 438 aa7.32□□□□□ -1.24
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RBM39-241ENST00000496183 DIO2Q92813 273 aa7.32□□□□□ -1.24
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RBM39-241ENST00000496183 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 ST7Q9NRC1 585 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 SCG5P05408 212 aa7.31□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 CDR1P51861 262 aa7.31□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 RAB33AQ14088 237 aa7.31□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.31□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.31□□□□□ -1.24
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