RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 CRYMQ14894 314 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 WTAPQ15007 396 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 LDLRAD1Q5T700 205 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 VPS52Q8N1B4 723 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 EXOC6Q8TAG9 804 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRCC1Q9C099 1032 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PLSCR2Q9NRY7 297 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC39Q9UFE4 941 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TCP10L2B9ZVM9 353 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 INPP5BP32019 993 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM62Q0P6H9 643 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP3K11Q16584 847 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SNX32Q86XE0 403 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 DPF3Q92784 378 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCG4Q9H172 646 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CASS4Q9NQ75 786 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PNMA3Q9UL41 463 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ERLIN1O75477 346 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CSF1RP07333 972 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 RPSAP08865 295 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 IL1R1P14778 569 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 FCGRTP55899 365 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 GSTO1P78417 241 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 DMPKQ09013 629 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 LAMB3Q13751 1172 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF20Q5VTR2 975 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PAF1Q8N7H5 531 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CD99L2Q8TCZ2 262 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 OPTNQ96CV9 577 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA1468Q9P260 1216 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 VAMP4O75379 141 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TAF5LO75529 589 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CRKP46108 304 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ITIH3Q06033 890 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TAF11Q15544 211 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 FKBP1CQ5VVH2 108 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF449Q6P9G9 518 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 MOB2Q70IA6 237 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 RASGRP2Q7LDG7 609 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 OTOP1Q7RTM1 612 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 C14orf80Q86SX3 495 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 GAS2L3Q86XJ1 694 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM151BQ8IW70 566 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP57L1Q8IYX8 460 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC89Q8N998 374 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB10Q96DT7 871 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ASIC4Q96FT7 647 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 OTUD5Q96G74 571 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ZIC5Q96T25 663 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TNMDQ9H2S6 317 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF9Q9HAQ2 790 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 LZTS1Q9Y250 596 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPN22Q9Y2R2 807 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM205AQ6ZU69 1335 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TBKBP1A7MCY6 615 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SGSM2O43147 1006 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 RTN2O75298 545 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 EGFRP00533 1210 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 IGKV5-2P06315 115 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 MCM4P33991 863 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 USP11P51784 963 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SPDYE2Q495Y8 402 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 C10orf76Q5T2E6 689 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SEPT14Q6ZU15 432 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ERMNQ8TAM6 284 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA5Q8TBA6 731 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD49Q8WVL7 239 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC35B4Q969S0 331 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 COA7Q96BR5 231 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC39A13Q96H72 371 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM53CQ9NYF3 392 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CLIC5Q9NZA1 410 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PRC1O43663 620 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ABL1P00519 1130 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 LDHBP07195 334 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CTAG1AP78358 180 aa5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms