RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa13.5□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 CNMDO75829 334 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 SMARCA1P28370 1054 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 INHBEP58166 350 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM132BQ14DG7 1078 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 CEP135Q66GS9 1140 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 TYW1BQ6NUM6 668 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 NUP62CLQ9H1M0 184 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 MYPNQ86TC9 1320 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZBTB5O15062 677 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 OSBPP22059 807 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 TYRO3Q06418 890 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 LBX2Q6XYB7 198 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 CPXCR1Q8N123 301 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 AGBL1Q96MI9 1066 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 PAGR1Q9BTK6 254 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRIM5Q9C035 493 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 HOXC10Q9NYD6 342 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 RBPJLQ9UBG7 517 aa13.49□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 ADGRA2Q96PE1 1338 aa13.48□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 NEMFO60524 1076 aa13.48□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 CDKL5O76039 1030 aa13.48□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 MAP2K2P36507 400 aa13.48□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 CRHR2Q13324 411 aa13.48□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 WWC2Q6AWC2 1192 aa13.48□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 PLA2G4DQ86XP0 818 aa13.48□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa13.48□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 TSPYL1Q9H0U9 437 aa13.48□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 PNMA3Q9UL41 463 aa13.48□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 RIPK3Q9Y572 518 aa13.48□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 GJB2P29033 226 aa13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF75DP51815 510 aa13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 FOSBP53539 338 aa13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 USH1GQ495M9 461 aa13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 FAM53CQ9NYF3 392 aa13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 MRVI1Q9Y6F6 885 aa13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 STK36Q9NRP7 1315 aa13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRIM22Q8IYM9 498 aa13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 COA7Q96BR5 231 aa13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 MTMR6Q9Y217 621 aa13.47□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 CAVIN2O95810 425 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 SCG2P13521 617 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 CDC25BP30305 580 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRT85P78386 507 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 LRMPQ12912 555 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 Q3C1V9 767 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 ERO1AQ96HE7 468 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 VPS54Q9P1Q0 977 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 CPA4Q9UI42 421 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 ELP1O95163 1332 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 ADAMTS3O15072 1205 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZBED4O75132 1171 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 DEXIO95424 95 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 ICAM1P05362 532 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 PLS1Q14651 629 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 LUZP1Q86V48 1076 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 TNMDQ9H2S6 317 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 CBX8Q9HC52 389 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 HOMER2Q9NSB8 354 aa13.46□□□□□ -0.25
TIMMDC1-208ENST00000494664 OPLAHO14841 1288 aa13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 KMT5BQ4FZB7 885 aa13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 ALG1Q9BT22 464 aa13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 RNF186Q9NXI6 227 aa13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCPG1Q9ULG6 757 aa13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 STXBP3O00186 592 aa13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 CA12O43570 354 aa13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 TLR2O60603 784 aa13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRPA1O75762 1119 aa13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 ERVK-9P63128 1117 aa13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 ERVK-24P63145 666 aa13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 FBXO11Q86XK2 927 aa13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 MB21D1Q8N884 522 aa13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 AMNQ9BXJ7 453 aa13.45□□□□□ -0.26
TIMMDC1-208ENST00000494664 TEX13BQ9BXU2 312 aa13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms