RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	FUT2	Q10981	343 aa		29.9	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	LHX8	Q68G74	356 aa		29.89	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	MAF1	Q9H063	256 aa		29.89	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		29.89	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	CNGA1	P29973	690 aa		29.88	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	29.88	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		29.88	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	29.88	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	29.88	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		29.88	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	29.88	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		29.87	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	29.87	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	29.87	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	29.87	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	29.87	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	TRAF1	Q13077	416 aa		29.87	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	PPP2R5B	Q15173	497 aa		29.87	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	ARMCX2	Q7L311	632 aa		29.87	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		29.87	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	NID2	Q14112	1375 aa		29.87	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	29.86	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	29.86	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	COL20A1	Q9P218	1284 aa		29.86	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	29.86	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	29.86	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	ASB14	A6NK59	587 aa		29.85	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	SEPT4	O43236	478 aa		29.85	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	GHRHR	Q02643	423 aa		29.85	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	KATNBL1	Q9H079	304 aa		29.85	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		29.85	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		29.85	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	CFB	P00751	764 aa		29.84	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	29.84	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	HSD17B4	P51659	736 aa		29.84	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	MORC4	Q8TE76	937 aa		29.84	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	29.84	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		29.83	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	ACVR2B	Q13705	512 aa		29.83	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	29.83	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		29.83	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		29.83	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	29.83	■■■□□ 2.37
TTC3-223	ENST00000492275	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		29.82	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	CAPN2	P17655	700 aa		29.82	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	ANO1	Q5XXA6	986 aa		29.82	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	DNER	Q8NFT8	737 aa		29.82	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		29.81	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	MSC	O60682	206 aa		29.81	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		29.81	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	29.8	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	NTRK3	Q16288	839 aa		29.8	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		29.8	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	KIF2C	Q99661	725 aa		29.8	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		29.8	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	EDNRB	P24530	442 aa		29.79	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	29.79	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	AK2	P54819	239 aa		29.79	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	POLR2M	P0CAP2	368 aa		29.78	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	AKR1A1	P14550	325 aa		29.78	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	NEK4	P51957	841 aa		29.78	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		29.78	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	29.78	■■■□□ 2.36	3e-8	■□□□□ 9.8
TTC3-223	ENST00000492275	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		29.78	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		29.78	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		29.77	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		29.77	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		29.77	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		29.77	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		29.77	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	RMDN3	Q96TC7	470 aa		29.77	■■■□□ 2.36
TTC3-223	ENST00000492275	ADCY6	O43306	1168 aa		29.76	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	STK3	Q13188	491 aa		29.76	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		29.76	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	IFNAR1	P17181	557 aa		29.75	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	ANKRD1	Q15327	319 aa		29.75	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		29.75	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	PHKB	Q93100	1093 aa		29.75	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	VTA1	Q9NP79	307 aa		29.75	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	PXMP2	Q9NR77	195 aa		29.75	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	MEIS2	O14770	477 aa		29.74	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	PPFIA3	O75145	1194 aa		29.74	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	RARB	P10826	455 aa		29.74	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	PDE4D	Q08499	809 aa		29.74	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	PKN1	Q16512	942 aa		29.74	■■■□□ 2.35
TTC3-223	ENST00000492275	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		29.74	■■■□□ 2.35

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