RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 SPZ1Q9BXG8 430 aa28.26■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa28.25■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 IQSEC1Q6DN90 963 aa28.25■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa28.25■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 LRRC37A2A6NM11 1700 aa28.25■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 H0YGN5 161 aa28.24■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 GHRHRQ02643 423 aa28.24■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 CYTH3O43739 400 aa28.23■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 ADAMTS4O75173 837 aa28.23■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 PGK1P00558 417 aa28.23■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 TNFAIP2Q03169 654 aa28.23■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.23■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 HOMER1Q86YM7 354 aa28.23■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 PIGSQ96S52 555 aa28.23■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 PHF24Q9UPV7 400 aa28.23■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa28.22■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 EDNRBP24530 442 aa28.22■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 CST5P28325 142 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 GJA9P57773 515 aa28.22■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 NKX3-2P78367 333 aa28.22■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 PDE4DQ08499 809 aa28.22■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 SLC35G1Q2M3R5 365 aa28.22■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 KLHDC9Q8NEP7 349 aa28.22■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 MYL10Q9BUA6 226 aa28.22■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 LRRC2Q9BYS8 371 aa28.22■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 Q9Y3F1 56 aa28.22■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 MOXD2PA6NHM9 499 aa28.21■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 PSMA5P28066 241 aa28.21■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 TAPT1Q6NXT6 567 aa28.21■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 FANCBQ8NB91 859 aa28.21■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 IWS1Q96ST2 819 aa28.21■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 SNX14Q9Y5W7 946 aa28.21■■■□□ 2.11
EHD1-211ENST00000489379 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 ADCYAP1R1P41586 468 aa28.2■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 HSD17B4P51659 736 aa28.2■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 RCAN1P53805 252 aa28.2■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 LRRC26Q2I0M4 334 aa28.2■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 C1orf53Q5VUE5 145 aa28.2■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 CFBP00751 764 aa28.19■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 APOA5Q6Q788 366 aa28.19■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.19■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa28.19■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 C7orf61Q8IZ16 206 aa28.19■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 TBC1D5Q92609 795 aa28.19■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 FGD1P98174 961 aa28.18■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 PPP2R5BQ15173 497 aa28.18■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 EEPD1Q7L9B9 569 aa28.18■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 FBXL16Q8N461 479 aa28.18■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 AP5M1Q9H0R1 490 aa28.18■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 ADCY6O43306 1168 aa28.17■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 SNX17Q15036 470 aa28.17■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 MICU3Q86XE3 530 aa28.17■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 RMDN3Q96TC7 470 aa28.17■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 USP26Q9BXU7 913 aa28.17■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa28.16■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 OPLAHO14841 1288 aa28.16■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 ZBTB43O43298 467 aa28.16■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 ACLYP53396 1101 aa28.16■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 KCNA10Q16322 511 aa28.16■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 DUSP28Q4G0W2 176 aa28.16■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 SCFD2Q8WU76 684 aa28.16■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 TAAR1Q96RJ0 339 aa28.16■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 PDGFCQ9NRA1 345 aa28.16■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 PLEKHA8P1O95397 391 aa28.15■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 POLR2MP0CAP2 368 aa28.15■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 SMPD1P17405 629 aa28.15■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 STXBP2Q15833 593 aa28.15■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 GNASQ5JWF2 1037 aa28.15■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 ARHGEF16Q5VV41 709 aa28.15■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 TMTC3Q6ZXV5 915 aa28.15■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 TLK2Q86UE8 772 aa28.15■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 TCEANC2Q96MN5 208 aa28.15■■■□□ 2.1
EHD1-211ENST00000489379 WDR11Q9BZH6 1224 aa28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms