RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487591.5

RRM2-208, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory subunit M2, human

TSL 2

Gene RRM2, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2-208	ENST00000487591	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	IQCF3	P0C7M6	154 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	OAZ1	P54368	228 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	AAK1	Q2M2I8	961 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	SLFN13	Q68D06	897 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	MORC4	Q8TE76	937 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	COPS5	Q92905	334 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	HLA-C	Q95604	372 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	ACAD9	Q9H845	621 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	INCENP	Q9NQS7	918 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	FEM1B	Q9UK73	627 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591		M0R2C6	588 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	BMP3	P12645	472 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	ALAS1	P13196	640 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	DEFB103A	P81534	67 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	FBXO40	Q9UH90	709 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	COG5	Q9UP83	839 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	TRIO	O75962	3097 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	ASB14	A6NK59	587 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	FOXP2	O15409	715 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	NMT2	O60551	498 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	IL9	P15248	144 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	MCC	P23508	829 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	KCTD1	Q719H9	257 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	SLC9A7	Q96T83	725 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	COG6	Q9Y2V7	657 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591		Q9Y3F1	56 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	NFIB	O00712	420 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	TTLL1	O95922	423 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	MYL3	P08590	195 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	SI	P14410	1827 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	TECTA	O75443	2155 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	GPAA1	O43292	621 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	ARIH2	O95376	493 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	PFKM	P08237	780 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	STAT2	P52630	851 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	NSMF	Q6X4W1	530 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	WNT8B	Q93098	351 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	GMCL1	Q96IK5	515 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	PHOX2B	Q99453	314 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	10.34	□□□□□ -0.75	1e-7	■■■□□ 16.4
RRM2-208	ENST00000487591	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	VTA1	Q9NP79	307 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	C5orf42	Q9H799	3197 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	LINC01553	A4QN01	128 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RRM2-208	ENST00000487591	ZEB2	O60315	1214 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RRM2-208	ENST00000487591	NBN	O60934	754 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RRM2-208	ENST00000487591	SLC16A2	P36021	539 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RRM2-208	ENST00000487591	MRE11	P49959	708 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RRM2-208	ENST00000487591	TFAP4	Q01664	338 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RRM2-208	ENST00000487591	HIC1	Q14526	733 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RRM2-208	ENST00000487591	MBTPS1	Q14703	1052 aa		10.33	□□□□□ -0.76

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