RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 PLA2G6O60733 806 aa11.76□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 SLFN14P0C7P3 912 aa11.76□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 HUNKP57058 714 aa11.76□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 PNOCQ13519 176 aa11.76□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 POSTNQ15063 836 aa11.76□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 DHX58Q96C10 678 aa11.76□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 FEM1BQ9UK73 627 aa11.76□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A087X0B3 334 aa11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 BIN1O00499 593 aa11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 SNAP25P60880 206 aa11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 GRM1Q13255 1194 aa11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 AP3B2Q13367 1082 aa11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 IQCB1Q15051 598 aa11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 DPCR1Q3MIW9 517 aa11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 IQUBQ8NA54 791 aa11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 LPAR1Q92633 364 aa11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 AK8Q96MA6 479 aa11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 ZIC5Q96T25 663 aa11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 BPIFA3Q9BQP9 254 aa11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa11.75□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 DOCK1Q14185 1865 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A087WWV3 80 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 BECN2A8MW95 431 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR46O15213 610 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 SMC2O95347 1197 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 ADCY5O95622 1261 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC10A3P09131 477 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP2K2P36507 400 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 E2F4Q16254 413 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 CALCRLQ16602 461 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 USH1GQ495M9 461 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 NT5DC1Q5TFE4 455 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP4R3AQ6IN85 833 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 SMARCE1Q969G3 411 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 KIFC2Q96AC6 838 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 ANO3Q9BYT9 981 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 CCSER1Q9C0I3 900 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 PRDM10Q9NQV6 1147 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF112Q9UJU3 913 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa11.74□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 USP17L15C9J2P7 530 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 USP17L11C9JVI0 530 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 USP17L18D6R9N7 530 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 USP17L22D6RA61 530 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 USP17L19D6RCP7 530 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 USP17L20D6RJB6 530 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 TDP2O95551 362 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 PRR29P0C7W0 189 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 INPP5BP32019 993 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 UBA7P41226 1012 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 USP17L24Q0WX57 530 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM266Q2M3C6 531 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 RGMBQ6NW40 437 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 PDXDC2PQ6P474 469 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 MOB2Q70IA6 237 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 POTEDQ86YR6 584 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 RASAL3Q86YV0 1011 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 SCYL3Q8IZE3 742 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIML1Q8N9V2 468 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 PAGE5Q96GU1 130 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 MTMR9Q96QG7 549 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 AS3MTQ9HBK9 375 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 PICK1Q9NRD5 415 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC39Q9UFE4 941 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 MAN1B1Q9UKM7 699 aa11.73□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 ABCB11O95342 1321 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 SPDYE3A6NKU9 549 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 PIK3CDO00329 1044 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 MEIS2O14770 477 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC37A4O43826 429 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 EDIL3O43854 480 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 STAT6P42226 847 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 USP11P51784 963 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 LBX1P52954 281 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 USP14P54578 494 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 FKBP1BP68106 108 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 PLCB2Q00722 1185 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 NOGQ13253 232 aa11.72□□□□□ -0.53
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