RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 FUT2Q10981 343 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 PPP2R5BQ15173 497 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 SGPL1O95470 568 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 ARMCX2Q7L311 632 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 BRCA2P51587 3418 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 CNGA1P29973 690 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 GHRHRQ02643 423 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 TBC1D5Q92609 795 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 ASB14A6NK59 587 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 SEPT4O43236 478 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 MSCO60682 206 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 CFBP00751 764 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 RGS19P49795 217 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 HSD17B4P51659 736 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 DNERQ8NFT8 737 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 COL20A1Q9P218 1284 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 LHX8Q68G74 356 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 MORC4Q8TE76 937 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 KATNBL1Q9H079 304 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 CAPN2P17655 700 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 NEK4P51957 841 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 AK2P54819 239 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 ACVR2BQ13705 512 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 ANKRD1Q15327 319 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 AKR1A1P14550 325 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 KIF2CQ99661 725 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRN-216ENST00000486480 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 POLR2MP0CAP2 368 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 EDNRBP24530 442 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 STK3Q13188 491 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 NTRK3Q16288 839 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 ANO1Q5XXA6 986 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 RMDN3Q96TC7 470 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 IFNAR1P17181 557 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 PDE4DQ08499 809 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.06■■□□□ 1.12
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PTPRN-216ENST00000486480 PHKBQ93100 1093 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 VTA1Q9NP79 307 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 PXMP2Q9NR77 195 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 B4DLN1 442 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 STXBP3O00186 592 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 PIK3CDO00329 1044 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 CPLX1O14810 134 aa22.04■■□□□ 1.12
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