RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
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RABGEF1-207ENST00000484547 TET1Q8NFU7 2136 aa13.91□□□□□ -0.18
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RABGEF1-207ENST00000484547 KRT40Q6A162 431 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC30A10Q6XR72 485 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-207ENST00000484547 PI4K2BQ8TCG2 481 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-207ENST00000484547 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
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RABGEF1-207ENST00000484547 TTC41PQ6P2S7 1318 aa13.84□□□□□ -0.19
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