RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 ZPBP2Q6X784 338 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 DEPDC5O75140 1603 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 REREQ9P2R6 1566 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 IQGAP3Q86VI3 1631 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 CRBNQ96SW2 442 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 GINM1Q9NU53 330 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 ABCC3O15438 1527 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 BCORL1Q5H9F3 1711 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 NRDCO43847 1150 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 BMP8BP34820 402 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 CTSKP43235 329 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRF1Q5T601 910 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 DCAF15Q66K64 600 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 GPRASP2Q96D09 838 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA32Q96LK8 384 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 PRR13Q9NZ81 148 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 E9PCH4 1651 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 GSNP06396 782 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 RTP1P59025 263 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 NLRX1Q86UT6 975 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 C1QL4Q86Z23 238 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 RGS22Q8NE09 1264 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 KCNN1Q92952 543 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 ZMYM3Q14202 1370 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 OR14I1A6ND48 311 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 SHOXO15266 292 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF205O95201 554 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 GLDCP23378 1020 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 NAT16Q8N8M0 369 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 SHISA4Q96DD7 197 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 MADDQ8WXG6 1647 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 NPATQ14207 1427 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 TET3O43151 1660 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 PLA2R1Q13018 1463 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 EFCAB6Q5THR3 1501 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 NOTOA8MTQ0 251 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 KRT1P04264 644 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 MED14OSP0DP75 135 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 VAV1P15498 845 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 KCNA10Q16322 511 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 RGL3Q3MIN7 710 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 GP6Q9HCN6 339 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 UGGT1Q9NYU2 1555 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 LMTK2Q8IWU2 1503 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 H0Y8X5 98 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-211ENST00000484135 SEMA7AO75326 666 aa6.72□□□□□ -1.33
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