RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 SEC16BQ96JE7 1060 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 CDADC1Q9BWV3 514 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 VPS11Q9H270 941 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 RXFP1Q9HBX9 757 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 ZNRF3Q9ULT6 936 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 PRR36Q9H6K5 1346 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 PLATP00750 562 aa5.18□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 TMEM201Q5SNT2 666 aa5.18□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 FBXW10Q5XX13 1052 aa5.18□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.18□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 EHMT1Q9H9B1 1298 aa5.18□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 ZNF408Q9H9D4 720 aa5.18□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.18□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 FAN1Q9Y2M0 1017 aa5.18□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 FZD7O75084 574 aa5.17□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 ATE1O95260 518 aa5.17□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 DBHP09172 617 aa5.17□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 GBP1P32455 592 aa5.17□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 NBPF9Q3BBW0 867 aa5.17□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 OVOS1Q6IE37 1185 aa5.17□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 TTC9BQ8N6N2 239 aa5.17□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 FERD3LQ96RJ6 166 aa5.17□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 UBOX5O94941 541 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 ACRP10323 421 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 GIPRP48546 466 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 ZNF165P49910 485 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 PRR5P85299 388 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 PALM2Q8IXS6 379 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 DRC1Q96MC2 740 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 SYT3Q9BQG1 590 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 INVSQ9Y283 1065 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-208ENST00000483859 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP5.15□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 ASGR2P07307 311 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 ATP2B1P20020 1258 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 TACR1P25103 407 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 CTSKP43235 329 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 SARSP49591 514 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 ICAM4Q14773 271 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 NR1I3Q14994 352 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 VPS37DQ86XT2 251 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 ATG4CQ96DT6 458 aa5.15□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PQY0 241 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 MEIS3P2A8K0S8 358 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 F8W031 263 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 ARSHQ5FYA8 562 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 CPLX3Q8WVH0 158 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 SPATA32Q96LK8 384 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 SLC9A7Q96T83 725 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 ZNF536O15090 1300 aa5.14□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 B2RBV5 119 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 KLF4O43474 513 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 NME1P15531 152 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 CHMP4BP1P59074 171 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 BICRALQ6AI39 1079 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 CRTC3Q6UUV7 619 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 ANKS3Q6ZW76 656 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 GMIPQ9P107 970 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 LTBP3Q9NS15 1303 aa5.13□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PQ27 194 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PQ64 194 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PQC6 194 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PQD8 194 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 SIGLEC6O43699 453 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 STK10O94804 968 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 PMLP29590 882 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 RBL2Q08999 1139 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 NLRC3Q7RTR2 1065 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa5.12□□□□□ -1.59
SENP6-208ENST00000483859 UBXN4Q92575 508 aa5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms