RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480996.1

KDM4C-208, Transcript of lysine demethylase 4C, human

TSL 3

Gene KDM4C, Length 405 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4C-208	ENST00000480996	COG1	Q8WTW3	980 aa		5	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC39A13	Q96H72	371 aa		5	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	FBXL18	Q96ME1	805 aa		5	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		5	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ASPN	Q9BXN1	380 aa		5	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		5	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		5	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		5	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	TNKS	O95271	1327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	LCE2B	O14633	110 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	TBX3	O15119	743 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	CRTAM	O95727	393 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	FGA	P02671	866 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	HSPA6	P17066	643 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ITIH2	P19823	946 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ETV3	P41162	512 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	GFRA1	P56159	465 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ZNF445	P59923	1031 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	KRT85	P78386	507 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	AMPD2	Q01433	879 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	GBX1	Q14549	363 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996		Q6ZNB5	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	SCLY	Q96I15	445 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	RNF112	Q9ULX5	631 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	TCEA3	O75764	348 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	PRKD3	O94806	890 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	IL33	O95760	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	SCG5	P05408	212 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	IL31	Q6EBC2	164 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	CDH24	Q86UP0	819 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	IRF7	Q92985	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	BRF1	Q92994	677 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	MIPEP	Q99797	713 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	BLACE	A4D250	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	CBX4	O00257	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	SLITRK5	O94991	958 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	LTF	P02788	710 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	MYL3	P08590	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ELN	P15502	786 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	MAN1A1	P33908	653 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	ECI1	P42126	302 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	NEK3	P51956	506 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KDM4C-208	ENST00000480996	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61

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