RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479339.5

CNKSR3-204, Transcript of CNKSR family member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CNKSR3, Length 2,023 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR3-204ENST00000479339 EHD4Q9H223 541 aa14.66□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 FOXN1O15353 648 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 PNOCQ13519 176 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 NAA25Q14CX7 972 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 LRRC24Q50LG9 513 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 CCDC102BQ68D86 513 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 CEP57Q86XR8 500 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 AIDAQ96BJ3 306 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 CDCA5Q96FF9 252 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 CERS5Q8N5B7 392 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 P3H4Q92791 437 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 C8orf76Q96K31 380 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR3-204ENST00000479339 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 LAMA4Q16363 1823 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 WNT10BO00744 389 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 ATP5JP18859 108 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 PBX1P40424 430 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 GUCY1B3Q02153 619 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 PTPN21Q16825 1174 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 METTL24Q5JXM2 366 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 HOMEZQ8IX15 550 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 CENPHQ9H3R5 247 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 SEMA3EO15041 775 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 HSF2BPO75031 334 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 SASH1O94885 1247 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 PRPHP41219 470 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 HUNKP57058 714 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 RBL2Q08999 1139 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 TRIM14Q14142 442 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 RESP18Q5W5W9 173 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 FBXL16Q8N461 479 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 CCDC114Q96M63 670 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 PDE8BO95263 885 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 CYP21A2P08686 494 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 NEFHP12036 1026 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 LSP1P33241 339 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 ATP2B2Q01814 1243 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 PDCLQ13371 301 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 NNTQ13423 1086 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 EMBQ6PCB8 327 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 FUKQ8N0W3 1084 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 SAAL1Q96ER3 474 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 MYBL2P10244 700 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 GYG1P46976 350 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 EPHB4P54760 987 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 ITIH3Q06033 890 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 PDE4BQ07343 736 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 ZMYM6O95789 1325 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 EYA2O00167 538 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 AOC2O75106 756 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 PPP1R37O75864 691 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 FAM107AO95990 144 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 FKBP1BP68106 108 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR3-204ENST00000479339 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms