RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474409.1

CNN3-205, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CNN3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-205ENST00000474409 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.55□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 ADGRA2Q96PE1 1338 aa9.55□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 BTBD18B2RXH4 712 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 POLR2MP0CAP2 368 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 ERCC3P19447 782 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 MAP2K2P36507 400 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 RESTQ13127 1097 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 NR5A1Q13285 461 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 AP3B2Q13367 1082 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 NPY5RQ15761 445 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 MUM1L1Q5H9M0 696 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 SLC30A10Q6XR72 485 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 OXER1Q8TDS5 423 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 MORF4L1Q9UBU8 362 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 RIPK3Q9Y572 518 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 PFASO15067 1338 aa9.54□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 PIK3CDO00329 1044 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 OPLAHO14841 1288 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 CA12O43570 354 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 TLR2O60603 784 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 MCTP2Q6DN12 878 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 SHCBP1Q8NEM2 672 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 PGBD1Q96JS3 809 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 ANO3Q9BYT9 981 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 MROH8Q9H579 483 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 TMEM260Q9NX78 707 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.53□□□□□ -0.88
CNN3-205ENST00000474409 FAM205CA6NFA0 338 aa9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 M0R2N6 131 aa9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 MEIS2O14770 477 aa9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 ADAMTS3O15072 1205 aa9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 FOSP01100 380 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 BCRP11274 1271 aa9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 MAPK4P31152 587 aa9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 HSD17B4P51659 736 aa9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 KCTD2Q14681 263 aa9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 Q3C1V9 767 aa9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 TNFRSF25Q93038 417 aa9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 MMP19Q99542 508 aa9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 PORCNQ9H237 461 aa9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 EFCC1Q9HA90 598 aa9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.52□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 TRPA1O75762 1119 aa9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 FCER1AP12319 257 aa9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 ATP2B1P20020 1258 aa9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 KRT85P78386 507 aa9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 GHRHRQ02643 423 aa9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 INF2Q27J81 1249 aa9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 FAM173BQ6P4H8 233 aa9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 C17orf99Q6UX52 265 aa9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 NEK8Q86SG6 692 aa9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 TBCKQ8TEA7 893 aa9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 TBC1D5Q92609 795 aa9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 GBP4Q96PP9 640 aa9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.51□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 POTEB2H3BUK9 544 aa9.5□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 TBC1D8O95759 1140 aa9.5□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 TRAPPC10P48553 1259 aa9.5□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 UBXN2AP68543 259 aa9.5□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 LETM2Q2VYF4 491 aa9.5□□□□□ -0.89
CNN3-205ENST00000474409 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms