RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, humanhuman

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCN-208ENST00000471364 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 SMIM22K7EJ46 135 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 ADAMTS4O75173 837 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 EPHB4P54760 987 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 DDX11Q96FC9 970 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 LY9Q9HBG7 655 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 SENP2Q9HC62 589 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.68□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 ACLYP53396 1101 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 FAAP100Q0VG06 881 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 SBK1Q52WX2 424 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 REPS2Q8NFH8 660 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 TOMM22Q9NS69 142 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 VCANP13611 3396 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 CDH23Q9H251 3354 aa14.67□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 FGRP09769 529 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 DNAJB2P25686 324 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 LIFRP42702 1097 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 KCNA10Q16322 511 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 MTA3Q9BTC8 594 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 MYO9BQ13459 2157 aa14.66□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 TIMP1P01033 207 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 GRIN2CQ14957 1233 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 CCDC174Q6PII3 467 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 APOA5Q6Q788 366 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 ZNF576Q9H609 170 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 ELP1O95163 1332 aa14.65□□□□□ -0.06
RUBCN-208ENST00000471364 NID2Q14112 1375 aa14.64□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.075e-7■■■■■ 28.6
RUBCN-208ENST00000471364 WTAPQ15007 396 aa14.64□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 FERMT3Q86UX7 667 aa14.64□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 ESR2Q92731 530 aa14.64□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.64□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.64□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 SPC25Q9HBM1 224 aa14.64□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 NYAP2Q9P242 653 aa14.64□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 KIF3AQ9Y496 699 aa14.64□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 GBF1Q92538 1859 aa14.63□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.63□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 CCDC69A6NI79 296 aa14.63□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.63□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 F5H6K3 240 aa14.63□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 ATP2A1O14983 1001 aa14.63□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 ZBTB43O43298 467 aa14.63□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 ORC4O43929 436 aa14.63□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 ZBED4O75132 1171 aa14.63□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RUBCN-208ENST00000471364 KLRC3Q07444 240 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms