RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 CALCRLQ16602 461 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA1328Q86T90 577 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 PDHBP11177 359 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 ADRA2BP18089 450 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 OAS2P29728 719 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 RAB34Q9BZG1 259 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM260Q9NX78 707 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 MYH1P12882 1939 aa20.46■□□□□ 0.87
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SYNE4-204ENST00000465425 KRT86O43790 486 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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SYNE4-204ENST00000465425 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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SYNE4-204ENST00000465425 BBOX1O75936 387 aa20.45■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 ADCY7P51828 1080 aa20.45■□□□□ 0.87
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SYNE4-204ENST00000465425 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.45■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.45■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.45■□□□□ 0.87
SYNE4-204ENST00000465425 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.45■□□□□ 0.87
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SYNE4-204ENST00000465425 AMPD2Q01433 879 aa20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 COA7Q96BR5 231 aa20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 PNKPQ96T60 521 aa20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC66A2RUB6 948 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 HERVK_113P62684 666 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.44■□□□□ 0.86
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SYNE4-204ENST00000465425 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 POLLQ9UGP5 575 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 ERICH4A6NGS2 130 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 KLK7P49862 253 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 GPS2Q13227 327 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 MTMR9Q96QG7 549 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 TUBBP07437 444 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 HDXQ7Z353 690 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 HPS3Q969F9 1004 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 ENC1O14682 589 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 GTF2IP78347 998 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 GRB10Q13322 594 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 MCM6Q14566 821 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 MIIPQ5JXC2 388 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
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SYNE4-204ENST00000465425 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 GBP3Q9H0R5 595 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 LY75O60449 1722 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 GYS1P13807 737 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 CYP2C19P33261 490 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 IQCDQ96DY2 449 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.42■□□□□ 0.86
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SYNE4-204ENST00000465425 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 MAP2K7O14733 419 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 SLC37A4O43826 429 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 TDP2O95551 362 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 FIGNQ5HY92 759 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 TAF3Q5VWG9 929 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 KRT79Q5XKE5 535 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 CENPPQ6IPU0 288 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-204ENST00000465425 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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