RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 RASIP1Q5U651 963 aa9.97□□□□□ -0.81
GAPDHP28-201ENST00000455134 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.97□□□□□ -0.81
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC30A10Q6XR72 485 aa9.97□□□□□ -0.81
GAPDHP28-201ENST00000455134 EEPD1Q7L9B9 569 aa9.97□□□□□ -0.81
GAPDHP28-201ENST00000455134 TLK2Q86UE8 772 aa9.97□□□□□ -0.81
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHD1LQ86WJ1 897 aa9.97□□□□□ -0.81
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLT1D1Q96MS3 346 aa9.97□□□□□ -0.81
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GAPDHP28-201ENST00000455134 CPVLQ9H3G5 476 aa9.97□□□□□ -0.81
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.97□□□□□ -0.81
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.97□□□□□ -0.81
GAPDHP28-201ENST00000455134 UMODL1Q5DID0 1318 aa9.97□□□□□ -0.81
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.96□□□□□ -0.81
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
GAPDHP28-201ENST00000455134 EVPLQ92817 2033 aa9.96□□□□□ -0.81
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCDC2CA8MYV0 355 aa9.96□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.96□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 DLL1O00548 723 aa9.96□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 AAMPQ13685 434 aa9.96□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM240Q5SV17 173 aa9.96□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 MFSD5Q6N075 450 aa9.96□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 NSMFQ6X4W1 530 aa9.96□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 RILPL2Q969X0 211 aa9.96□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.96□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 TOMM22Q9NS69 142 aa9.96□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 MROH7Q68CQ1 1323 aa9.96□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.96□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 MUC3AQ02505 3323 aa9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 CSF2RAP15509 400 aa9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 EDNRBP24530 442 aa9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDE4AP27815 886 aa9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSMC6P62333 389 aa9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 IQSEC1Q6DN90 963 aa9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYLIPQ8WY64 445 aa9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTC14Q96N46 770 aa9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 WNT8AQ9H1J5 351 aa9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 VTA1Q9NP79 307 aa9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.95□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 B4E1Z4 1266 aa9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 B4GALT4O60513 344 aa9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 GOLGA8HP0CJ92 632 aa9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACRP10323 421 aa9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP2C18P33260 490 aa9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ITGA7Q13683 1181 aa9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 DUSP28Q4G0W2 176 aa9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBC1D5Q92609 795 aa9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKS1AQ92625 1134 aa9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPC25Q9HBM1 224 aa9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 COL20A1Q9P218 1284 aa9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q9Y3F1 56 aa9.94□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTPDC1A2A3K4 754 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 HAX1O00165 279 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 KDM4AO75164 1064 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARIH2O95376 493 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAJB2P25686 324 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 PBX2P40425 430 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 PURAQ00577 322 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRIN2CQ14957 1233 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC35G1Q2M3R5 365 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF365Q70YC5 407 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 DGKHQ86XP1 1220 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 PNMA1Q8ND90 353 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 COPS5Q92905 334 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBA5Q9GZZ9 404 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRPV6Q9H1D0 765 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.92□□□□□ -0.82
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF213O14771 459 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms