RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 LMCD1Q9NZU5 365 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ZNF212Q9UDV6 495 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 TLK1Q9UKI8 766 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 A2MP01023 1474 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 NVLO15381 856 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 OR52Z1P0C646 297 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 NEK8Q86SG6 692 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 RABGGTAQ92696 567 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 PGBD1Q96JS3 809 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 FGD4Q96M96 766 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 GRIN2AQ12879 1464 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SLMAPQ14BN4 828 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 NELFCDQ8IXH7 590 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SCOCQ9UIL1 159 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 CPP00450 1065 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 LMNAP02545 664 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ACTN1P12814 892 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 IGBP1P78318 339 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 XKR9Q5GH70 373 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SCYL3Q8IZE3 742 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 CENPKQ9BS16 269 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SNX14Q9Y5W7 946 aa7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 LRRC37BQ96QE4 947 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 DISC1Q9NRI5 854 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 DDX5P17844 614 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 TFAP4Q01664 338 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 LRCH2Q5VUJ6 765 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SPATA1Q5VX52 437 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 NOSTRINQ8IVI9 506 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 FBXL13Q8NEE6 735 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 PHKBQ93100 1093 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 FAM89AQ96GI7 184 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 PBKQ96KB5 322 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 CEP19Q96LK0 163 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 LCMT1Q9UIC8 334 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 PAMP19021 973 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 KRT80Q6KB66 452 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 FBXO11Q86XK2 927 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 NUDCD1Q96RS6 583 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ZNF532Q9HCE3 1301 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 GCP02774 474 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 CIITAP33076 1130 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 NT5C1BQ96P26 610 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ZMYM6O95789 1325 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SPDYE2BA6NHP3 402 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 DDAH1O94760 285 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SPDYE6P0CI01 402 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 TRAPPC10P48553 1259 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 NT5C2P49902 561 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 RAP1GDS1P52306 607 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 CCNA1P78396 465 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SNX1Q13596 522 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 RDH13Q8NBN7 331 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 PYGBP11216 843 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 MSH2P43246 934 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SESN3P58005 492 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SEPT2Q15019 361 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 LRRC43Q8N309 656 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 GCNAQ96QF7 691 aa7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 ATP5JP18859 108 aa7.24□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 MAP3K7CLP57077 242 aa7.24□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 RNF207Q6ZRF8 634 aa7.24□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 NACC1Q96RE7 527 aa7.24□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 FAM96AQ9H5X1 160 aa7.24□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 VPS54Q9P1Q0 977 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms